《基因組生物學》：中外豬種骨骼肌研究

8月6日出版的英國《基因組生物學》（Genome Biology）期刊發表了中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所李奎教授課題組唐中林博士、李勇碩士等關于中外豬種骨骼肌生長發育生長差異分子機制的重要研究成果。
 
豬肉是人類動物蛋白的主要來源，我國是世界上生豬生產和豬肉消費的第一大國。我國種豬長期依賴進口，西方豬種雖生長快和瘦肉率高，但口感風味較差。該問題已經引起普遍關注。我國地方豬種具有肉質優良的特點，以“鮮嫩多汁”馳名中外。解析中外豬種骨骼肌生長發育差異分子機制是培育優良豬種的基礎。
 
該研究以我國地方優良豬種—通城豬和著名瘦肉型豬—長白豬為研究對象，選取三個重要時間點（妊娠33天、65天和90天）的胚胎骨骼肌，利用LongSAGE技術比較分析其全基因組轉錄譜，從檢測的317115個表達標簽中鑒定了2648個差異表達基因。系統聚類分析發現兩品種在妊娠65天時基因表達差異最大，且通城豬妊娠65天的胚胎骨骼肌具有獨特的表達譜特征。對差異表達基因進行表達模式和本體論分析，發現骨骼肌發育過程中差異表達基因呈現8種不同表達模式，每種表達模式都分別富集了不同類別的功能基因。無論在表達模式還是富集的功能類別上，兩品種的表達基因都存在很大差異。細胞生物學合成、細胞增殖調控、有機酸代謝、大分子生物合成、調節細胞大小等相關基因多在通城豬骨骼肌發育過程中差異表達。此外，還發現通城豬骨骼肌的發育涉及到了更多類別功能的功能基因。
 
該研究認為，通城豬和長白豬的基因表達表型差異顯著，通城豬胚胎骨骼肌具有相對緩慢的生長速度和更復雜的分子機制，而增加細胞生長和成肌細胞生存的基因在長白豬中表達上調。他們還推測，妊娠65天可能是導致兩品種生長性狀差異顯著的重要時間點。
 
該研究由中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所、華中農業大學動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室、上海華冠生物芯片有限公司共同完成，全部工作均在國內完成。此項研究是國家自然科學基金重點項目資助課題，并得到國家863和973計劃資助。