《科學》：基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究

3000種基因經初次篩選后，大約24個符合要求

 
多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點，以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術，有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》（Science）上。
 
2005年，美國國立衛生研究院斥資15億美元發起“癌癥基因組地圖”（TCGA）項目，目的是搜尋在很多癌癥中發生變異的基因。不過有很多科學家批評說，TCGA過分強調基因測序而忽視了功能性研究，而后者能夠確定哪種變異是最重要的。哈佛醫學院的遺傳學家Stephen Elledge就是持這種觀點的人之一。
 
在最新的研究中，Elledge和冷泉港實驗室的分子生物學家Gregory Hannon及同事一道，構建了新的病毒載體，每一個載體都含有一個RNA分子，用來關閉帶有補充序列的基因。載體還帶有DNA“條形碼”，這樣研究人員稍后就能確定哪些RNA對細胞行為具有大的影響。研究人員將大約1萬到4萬個這樣的RNA插入到乳腺癌細胞、結腸癌及正常細胞中，主要分析了1萬個“短發夾”RNA（shRNA），結果發現標靶了大約3000種不同的基因。
 
接下來就是要看哪些RNA在不影響正常細胞的情況下，能夠減弱癌細胞的生存和增殖能力。研究人員的觀點是，這些用RNA干擾發現的基因與癌細胞的變異相一致，從而導致了不受控制的增殖。在第一遍篩選后，研究人員發現了大約24個基因符合要求。Elledge提醒說，此次研究僅僅是個開始，以確定哪種蛋白能作為好的藥靶。
 
一些科學家對這種方法充滿希望。美國波士頓Dana-Farber癌癥研究所的癌癥遺傳學家Ronald DePinho說：“我是這項技術的大‘粉絲’”。他認為，考慮到癌癥的復雜性，有必要同時調查腫瘤細胞基因組并檢測細胞如何對基因沉默作出反應。美國翻譯基因組學研究院（Translational Genomics Research Institute）的計算生物學家Michael Bittner則認為，如果這兩種方法能獨立地找出相互有關的基因，那么它將是一種非常有效的方法以決定下一步研究的優先次序。（科學網 梅進/編譯）
 
（《科學》（Science），Vol. 319. no. 5863, pp. 617 – 620，Stephen J. Elledge，Gregory J. Hannon）
 
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