RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在細胞的蛋白質加工廠中指揮蛋白質生產。為了制造蛋白質,機器的一端先鎖定在RNA上,然后掃描整條RNA,直到AUG字符串后停止掃描,AUG是將遺傳密碼翻譯成蛋白質的開始信號。
在巡查第一個AUG位點時,蛋白質制造機器經常會遇到一個與AUG不同的字符串(如AUA),有時,蛋白質合成也會從這樣的替代起始位點開始,迄今為止,蛋白質制造機器如何選擇使用哪些替代位點還是一個謎。
Nature》發表了一篇最新文章回答了這個問題。
“我們發現了一種翻譯事件選擇機制,可以解釋在非翻譯區域發起的非傳統起始位點問題,”凱斯西儲大學醫學院RNA分子生物學中心教授、文章通訊作者Eckhard Jankowsky博士說。“過去幾年,我們發現,在這些區域發生的翻譯現象十分普遍,但是蛋白質翻譯機器如何在數百萬個可能的起始位點中進行抉擇?”
Jankowsky課題組使用了一種名為Ded1p的酶,它是蛋白質制造機器的一部分。人類Ded1p突變版本與腫瘤和認知障礙有關。病毒通常也以關鍵的酶為靶點,破壞細胞內蛋白質合成。Jankowsky團隊構建了一株Ded1p有缺陷的酵母細胞,在這些細胞中,可用的替換起始位點(AUA或AAG)顯著增加。但是,細胞仍然只選擇使用其中一小部分替代位點。
這讓研究人員感到十分好奇,他們觀察細胞所選擇的替代起始位點都緊鄰RNA自身折疊區域。Ded1p是一種RNA解旋酶(解開折疊RNA結構的酶)。如果它有缺陷,RNA就只能維持折疊狀態,蛋白質制造機器掃描遇到這種RNA結構就會發生停滯,導致蛋白質合成不得不從附近的替代位點開始。
“這其實是一種由RNA結構和解旋酶組成的簡單機制,”Jankowsky說。“如果一個替代起始位點靠近這種RNA結構,它就會被用于啟動蛋白質合成。因此,RNA結構和替代起始位點共同決定了非傳統起始位點的蛋白質生產信號。”
由于所有生物體都含有Ded1p,該發現可能具有更廣泛的影響,替代起始位點的位置常常影響主要蛋白質生產,從而決定細胞內蛋白質平衡。
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