解析蛋白質的動態結構,能夠揭示蛋白質行使功能的內在機制。化學交聯質譜分析(Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry,CXMS),結合高靈敏質譜分析,是近十年發展起來的結構生物學技術。利用有特定長度的化學交聯劑將蛋白質中的特定氨基酸連接起來,可獲得蛋白質上特定氨基酸之間的距離信息。CXMS技術具有靈敏度高,不受分子量大小限制等特點,得到愈加廣泛的使用。
CXMS測量所獲得的距離約束傳統上施加于蛋白質的Cα原子或Cβ原子之間,這樣的距離約束會超過20,對結構精度的提升有限。針對這一問題,中國科學院精密測量科學與技術創新研究院副研究員龔洲、研究員唐淳發展建立了一種基于化學交聯質譜分析研究蛋白質結構和動態變化的新方法,對已有CXMS實驗數據進行比對分析,借鑒生物磁共振思路,將交聯劑修飾的側鏈Cω原子作為距離約束點。這種方法將約束范圍縮小到6以內,提高了蛋白質結構計算的精度,并可分析表征蛋白質結構的動態變化。
相關成果發表在Structure上,龔洲為論文第一作者,唐淳為通訊作者。研究得到科技部、國家自然科學基金委的資助。
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