
“萬種原生生物基因組計劃”30日在武漢啟動。該計劃由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起,旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規模的原生生物遺傳資源數據庫。
原生生物主要是由單細胞真核生物組成的一大類群,包括單細胞真核藻類和原生動物等。其分布廣泛,存在于任何水環境,已描述的物種數逾6萬種,未知種類難以估量。
據介紹,目前,國內外針對生物五大界中的四界(動物界、植物界、真菌界和原核生物界)均啟動了大型基因組測序計劃,原生生物界成為唯一沒有啟動大規模基因組測序計劃的生物類群。
中國原生生物學研究始于上世紀20年代。作為中國原生生物學(原生動物學和藻類學)的發源地,中科院水生所建有保藏了2500余種株真核藻類和近600種株原生動物的國家藻類和原生動物種質庫,近年來,依托原生生物基因組測序和生物信息分析平臺已完成500余種原生生物的基因組測序。
本次“萬種原生生物基因組計劃”由中科院水生所牽頭啟動。該所副所長、研究員繆煒介紹,該計劃將依托各發起單位保藏的3000多種株真核藻類和原生動物的種質資源,通過持續的樣品采集和宏基因組數據挖掘,在未來3年(2020年—2022年)完成約一萬種原生生物的基因組測序和分析,將包括原生生物全部26個門/類,覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。
據了解,該計劃將以開放聯盟模式運行,國內外有興趣研究團隊均可加入。繆煒表示,該計劃的開展將對理解生物多樣性形成機制、多細胞生物/有性生殖的起源與演化等重大基礎生命科學問題,推動與生態環境保護、營養健康和疾病防治相關原生生物種質遺傳資源的挖掘與應用實踐具有重要意義。
標準DNA條形碼憑借通用引物適配性強和測序成本低等優勢,廣泛應用于生物多樣性保護與溯源等領域。針對近緣種、雜交頻繁及近期輻射演化的復雜類群,標準DNA條形碼因序列變異度有限,分辨率不足,難以滿足精準鑒......
美國肯塔基大學馬丁·加頓農業、食品與環境學院團隊利用一頭雌性騾子的DNA,繪制出迄今最完整的馬和驢參考基因組,使科學家能夠進一步解析過去難以測序和組裝的著絲粒、端粒等復雜DNA區域,為研究染色體功能、......
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......