藥物靶標的識別與驗證是藥物發現過程中至關重要的第一步，在藥物研發過程中，30%-40%的在研藥物由于藥物靶標選擇的不恰當而以失敗告終。因此，發展一種高效的計算方法來預測新的藥物靶標就顯得尤其重要。
最近，中國科學院上海藥物研究所朱維良研究組發布免費在線藥物靶標預測平臺D3TPredictor，此平臺僅需提交蛋白質的一級序列，就可以進行藥物靶標預測，是第一個利用多算法與多模型聯合策略的藥物靶標預測平臺（http://www.d3pharma.com/d3tpredictor/），任何國內外用戶可免費訪問使用。
該平臺基于多步驟過濾的高質量的非靶標數據集和靶標數據集，發展基于多算法與多模型聯合的藥物靶標預測策略。基于3個數據集定性和定量的評估，得出不同算法及模型的優劣；通過一個隨機數據集的評估，進一步確證多算法多模型聯合策略較單算法單模型策略的優越性，并篩選出最佳的算法與模型組合：19組平行模型。臨床靶標數據集的測試已證明此組合策略的有效性。
應用此最佳組合策略，預測出人類蛋白質組含有約2000個全靶標和約4000個準靶標，人類蛋白質組有將近30%的蛋白質是潛在藥物靶標。在預測的潛在藥物靶標中，GPCR和激酶占主導，提示藥物研發人員在未來的靶標驗證工作中應優先考慮這兩類蛋白質。
該研究主要由朱維良研究組劉穎濤博士完成，相關論文發表于《中國藥理學報》(Acta Pharmacologica Sinica.2014, 35,419-431)。
多算法/多模型策略的示意圖
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