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  • 發布時間:2018-01-03 15:14 原文鏈接: 專家希望大數據能徹底改變癌癥研究

      癌癥研究人員曾對唐納德?特朗普替換美國國家癌癥研究所(NCI)主任Harold Varmus感到緊張。但在去年6月份,事實證明他們的擔心是毫無根據的,因為特朗普選擇了Norman “Ned” Sharpless接手NCI。

      現年51歲的Sharpless曾擔任北卡羅來納大學萊恩伯格綜合癌癥中心主任:他也是臨床醫生,建立了兩個生物技術公司,并管理著一個專注于基礎研究實驗室,致力于p16蛋白研究(該蛋白對細胞分裂和衰老至關重要)。

      Sharpless于去年10月走馬上任,接過了NCI的重擔。他花了兩個月分析和了解這個經費高達57億美元的研究所的信息。例如,他曾與6位在世的NCI前所長、NCI的受讓人以及內部員工交談過。

      近日,在接受媒體專訪時,Sharpless提到了三個他認為很重要的領域:大數據、基礎研究,以及將發現轉化為設備和治療。他表示,自己也一直在思考如何支持年輕研究者的事業,這也是NCI的母機構、國立衛生研究院(NIH)長期思考的問題。

      IBM計劃使用沃森超級計算機指導癌癥治療,但備受爭議。當被問及如何看待大數據時,Sharpless表示,100%相信人工智能和機器學習將會對癌癥研究和癌癥治療產生巨大影響。“(在北卡羅來納大學),我們利用沃森計算機組織了與新療法有關的文獻,以便分子腫瘤委員會依據基因突變決定給病人提供什么藥物。重點是它就像100萬個助手,非常快,那是超級有用的。”

      Sharpless還提到,數據資料的提取和整理是最難的部分。“讓學生閱讀圖表并把基因數據抽象出來太慢了,所以這些使用自然語言處理和提取記錄的工具非常有用。這將會給我們帶來百萬患者的臨床注釋和基因組數據集合,允許我們做真正需要做的事情。”他說。

      當被提及是否擔憂2018財年特朗普政府大幅削減NIH預算的計劃時,Sharpless指出,自己有義務支持總統的預算案。而且,國會對NIH預算的承諾是好的。在過去兩年里,預算已經大幅增加,而初步看來2018財年的預算也很有希望。“我認為預算上的挑戰是真實存在的。因為如果你考慮到癌癥的負擔或者社會的成本,那么57億美元是不夠的。”

      在對年輕研究人員的資助方面,Sharpless表示,NCI一直在考慮給一些新的年輕研究人員一個長期的研究資助基金。該機構會提出一個新的一攬子計劃。如果被批準的話,他們將獲得2年的額外資金。“這一過程或多或少只是為了確保他們仍在進步。”


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