馴化通常被看作是少數野生個體被人類隔離圈養，經過代代培育而形成家養物種的過程。在這個過程中，由于奠基者效應，可以預期到家養物種的遺傳多樣性與其野生祖先相比會有所降低，這點已經在大豆、玉米等農作物中被證實，然而人們對家養動物這方面卻知之甚少，究其原因，主要是大部分家養動物的野生祖先現在已經滅絕或處于瀕危狀態，為這方面的工作帶來困難。野豬是目前少有的遍布于世界各地的家養動物的野生祖先之一，為人們提供了很好的素材來對馴化進行深入研究。
在中國科學院昆明動物研究所張亞平院士的指導下，博士研究生季吟秋等通過測定來自核基因組11條染色體上的多個區段，并聯合前人所發表的線粒體基因組數據，對東亞的家豬和野豬進行分析比較。結果顯示，家豬的線粒體多樣度只有野豬的一半，這種遺傳水平的下降與馴化過程中的奠基者效應相吻合；然而出乎意料的是核基因組上的數據顯示了與線粒體截然不同的結果，即家豬的遺傳多樣度并不低于野豬。通過對多項可能影響遺傳多樣性的因子如DNA重組、基因流、選擇作用等進行分析，最終的推斷揭示了這種線粒體與核基因組的不一致很可能是被馴化后的雌性家豬與雄性野豬產生了大規模回交后的結果。
這項研究不僅僅揭示了豬在馴化后遺傳多樣性受到的影響，而且還為以后人工選擇方面的研究提供了良好的遺傳背景。
該研究成果已發表在國際開源刊物《公共科學圖書館·綜合》（PLoS ONE）上。
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