中國科學家9月參與發表多篇Nature文章

　　9月中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表，其中包括首次揭示m6A甲基化修飾的新作用，表觀遺傳調控核心復合物PRC2招募到基因組上重要位點的分子機制，以及蘭花基因關鍵演化機制。

　　來自中科院動物研究所，北京基因組研究所的研究人員通過m6A測序技術（m6A-Seq），首次揭示m6A甲基化修飾在造血干細胞發育中的關鍵作用，是該研究領域的重大科研突破。

　　研究人員通過m6A測序技術（m6A-Seq）發現，缺失m6A甲基轉移酶mettl3后，m6A在胚胎發育相關mRNA中的富集程度顯著下降。同時，在斑馬魚的血液-血管系統中，可檢測到mettl3的特異性表達。由此推測，m6A修飾與血液發育過程密切相關。

　　系統的表型檢測顯示，在mettl3缺失的胚胎中，造血干細胞不能正常產生，血管的內皮特性卻明顯增強，內皮-造血轉化過程受到阻斷。m6A-Seq和RNA-Seq綜合分析發現，在mettl3缺失的胚胎中，一系列動脈內皮發育相關的基因，尤其是notch1a的m6A修飾水平顯著降低，而其mRNA水平卻顯著升高。

　　上述結果證明，m6A修飾與EHT過程中內皮和造血基因表達的平衡調控相關。此外，YTHDF2-RIP-Seq和單堿基分辨率的m6A-miCLIP-Seq發現，m6A通過YTHDF2介導notch1a mRNA的穩定性，以維持EHT過程中內皮細胞和造血細胞基因表達的平衡，進而調控造血干細胞的命運決定。上述結果在小鼠中也得到了驗證，證明m6A對造血干細胞命運決定的調控在脊椎動物中是保守的。

　　北京師范大學生命科學學院的王占新教授首次發現PCL家族蛋白的EH結構域識別含有非甲基化CpG序列的DNA元件，揭示了表觀遺傳調控核心復合物PRC2招募到基因組上重要位點的分子機制，為進一步理解PCL家族蛋白在PRC2復合物中的生理功能，以及靶向與PRC2相關疾病開辟了一個全新的思路。

　　這項研究首次發現并證實了PCL家族蛋白是連接PRC2與CpG島的紐帶，該工作為PRC2復合物在染色質上CpG島特異的招募提供了直接的實驗證據，解決了困惑人們多年的關于PRC2在染色質上選擇性定位的這一重要問題，為進一步理解PCL家族蛋白在PRC2復合物中的生理功能，以及靶向與PRC2相關疾病開辟了一個全新的思路。

　　此外，由國家蘭科植物種質資源保護中心/深圳市蘭科植物保護研究中心，比利時根特大學，日本埼玉大學等處組成的研究小組發表了題為“The Apostasia genome and the evolution of orchids”的文章，利用PacBio，Illumina，以及10X Genomics的最新技術，全新解析了一種蘭花的基因組序列，這將有助于科學家們深入了解蘭花的進化以及適應機制。

　　在這篇文章中，研究人員首先從深圳擬蘭葉，莖和花的樣本中分離出基因組DNA，然后分別利用Illumina HiSeq 2000和PacBio RS測序儀獲得了短讀長和長讀長序列，將其組合在一起，再加上10X Genomics生成的scaffold數，完成了深圳擬蘭的基因組草圖，填補了空白。同時研究人員還利用新的轉錄組序列，進行比較基因組學和系統發育分析，進一步了解蘭花品種之間的親緣關系，以及進化蘭花特征。

　　“我們發現了新的基因家族，新擴增或減少的基因家族，還有MADS-box基因類別中出現的變化（調控蘭花進化過程中多個發育階段）。這項工作揭示了蘭花進化進程中的關鍵遺傳事件，”作者寫道。