來自南京醫科大學、清華大學、寧夏醫科大學總醫院等十多家機構的研究人員,通過全基因組關聯研究(GWAS)鑒別出了非綜合征性唇裂或唇腭裂(Nonsyndromic cleft lip with or without a cleft palate,NSCL/P)的一個新易感位點。這一研究成果發表在3月16日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。
南京醫科大學的沈洪兵(Hongbing Shen)教授、王林(Lin Wang)教授以及寧夏醫科大學總醫院的楊銀學(Yinxue Yang)教授是這篇論文的共同通訊作者。
先天性唇腭裂是人類最常見的先天性畸形之一,一般在危險因素致畸的作用下,發生在胚胎發育4~12周。唇腭裂患者不僅存在外形上的缺陷,其飲食、語言等功能也伴有不同程度的障礙,常常造成性格缺陷,影響正常的社會交往,降低生活質量,又因治療程序復雜、周期漫長、花費大、給家庭和社會帶來沉重負擔,嚴重影響了出生人口素質,因此尋找該病的病因,進而找到有效地預防手段顯得非常重要。
從遺傳學上唇腭裂分為綜合征性唇裂或唇腭裂、綜合征性腭裂、非綜合征性唇裂或唇腭裂(NSCL/P)和非綜合征性腭裂(NSCP)。綜合性唇腭裂一般因為染色體異常或單基因發生突變所致,病因比較明確。而非綜合性唇腭裂的發病原因至今醫學界仍無定論。NSCL/P的發病率為0.1-0.2%,其發病機制不明,病因復雜具有明顯遺傳異質性。研究結果發現,NSCL/P的發生是環境、遺傳因素以及二者相互作用的結果,其中遺傳因素起重要作用。
GWAS是一種對全基因組范圍內的常見遺傳變異(單核苷酸多態性和拷貝數)基因總體關聯分析的方法,在全基因組范圍內進行整體研究,能夠一次性對疾病進行輪廓性概覽,適用于復雜疾病的研究。在全基因組層面上,開展多中心、大樣本、反復驗證的基因與疾病的關聯研究,有可能全面揭示出疾病發生、發展與治療相關的遺傳基因。
在這篇文章中研究人員報告稱,他們在進行了第一輪基于病例對照的GWAS研究后又進行了兩輪的重復驗證。他們利用來自中國的6個獨立組群闡明了在中國人群中NSCL/P的遺傳結構。通過這樣的綜合分析,研究人員鑒別出了一個定位在16p13.3與NSCL/P相關的新位點:位于CREBBP和 ADCY9之間的rs8049367。他們還證實以往報道過的定位于1q32.2、10q25.3、17p13.1及20q12的位點也與中國人群 NSCL/P形成有關。
研究結果進一步地提供了證據證實,定位在1q32.2的rs2235371相關單體型相比以往在中國人群中發現的因果變異rs642961發揮了更重要的作用。這些研究發現為我們提供了有關NSCL/P遺傳基礎和機制的一些重要信息。
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