活化石是指起源古老,呈孑遺分布,并保留祖先形態特征的現存生物。這類生物通常有較低的分類多樣性和孤立的系統位置,且通常瀕臨滅絕或者亟需保護。然而,目前對活化石,特別是植物活化石的分子進化和和生態特性仍知之甚少。
中國科學院植物研究所王偉研究組以起源于白堊紀的活化石植物——領春木科(Eupteleaceae)為研究對象,通過整合系統發育基因組學、比較基因組學和生態位模擬等分析方法,研究了該科植物的分子進化速率及其機制。研究人員組裝了領春木科首個高質量的、染色體水平的核基因組,同時也組裝了葉綠體和線粒體基因組。研究結果表明,在真雙子葉植物最基部類群——毛茛目(Ranunculales)中,領春木科是最早分化的科,并與其他毛茛目物種共享一個古老的全基因組復制事件。領春木科的三套基因組,以及同一基因組內具有不同功能的基因都具有極低的分子進化速率,這可能與其保守的核基因組結構、木本習性以及保守的生態位需求有關。此外,研究還發現毛茛目早期分化的支系以及其他基部真雙子葉植物類群都參與了白堊紀早期的陸地革命。
該研究揭示了活化石植物在大尺度環境變化中如何進化和適應的,為早期真雙子葉植物的多樣化提供了新的見解,而且整合系統發育、比較基因組學和生態位模擬的分析策略可用于研究其他活化石植物的分子進化及其機制。
該成果于12月11日在線發表于國際學術期刊SCIENCE?CHINA Life Sciences。植物所助理研究員向坤莉和蘭州大學青年研究員武生聃為論文共同第一作者,植物所王偉研究員和中國農科院基因組所武志強研究員為共同通訊作者。該研究得到了中國科學院戰略性先導科技專項(B類)項目和國家自然科學基金面上項目的資助。
文章鏈接:http://engine.scichina.com/doi/10.1007/s11427-023-2448-x
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