“我們正在做人參的全基因組測序和基因表達譜的繪制,配合吉林省人參產業的新騰飛。我們首先要解決的關鍵問題包括種質資源調查、分子育種體系建立、農藝性狀與環境的關系等。”11月9日,在趕赴長春的前夕,中科院北京基因組所副所長于軍研究員接受了《科學時報》記者的獨家專訪,講述了“中國人參基因組計劃”的來龍去脈。
人參是舉世聞名的藥用植物,被譽為“萬能圣藥”,是國內外公認的珍品。遠在2000多年以前,我們的祖先就把人參用于臨床。現代醫學認為,人參對神經系統、心血管系統、內分泌系統、消化系統、生殖系統、呼吸系統及外科使用等都具有明顯的作用。我國是世界上人參生產的大國,也是人參消費的大國。
人參產業是吉林省的傳統資源優勢產業。但是近年來,人參產業與土地資源匱乏的矛盾日漸突出;人參栽培、加工、銷售等環節缺乏規范的統一管理;原料人參的質量參差不齊、市場價位低;具有自主知識產權的產品開發滯后。這些問題困擾著吉林省乃至整個東北的人參產業,吉林省想通過提升科技含量來“突圍”,于是找到中科院。
于軍說北京基因組研究所面向地方經濟發展,充當了這次合作中的“先鋒”——先測序人參的基因組和轉錄組,預覽人參的遺傳多樣性,繪制完整的人參“生命藍圖”。
“人參品種的遺傳多樣性我們還不甚清楚。人參分很多品種,比如高麗參、西洋參等等,同時還有很多栽培品種。哪些更古老,哪些是新品種,哪些更優良,哪些要淘汰,都需要深入的科學研究。”于軍表示。
今年8月,北京基因組研究所對紫鑫藥業提供的五加科人參屬植物人參啟動了全基因組測序的工作。目前,已經利用第二代測序技術進行大規模序列測定初步數據分析,接下來將重點推進長片段大規模的測序以及轉錄組研究工作。第三個階段將是對人參全基因組進行拼接、基因注釋、遺傳多樣性、農藝性狀、藥用性狀等系統研究。
于軍介紹說:“在揭秘人參種質資源的遺傳密碼之后,還需要找到人參遺傳部分和藥用部分之間的關聯,研究哪些成分是有效成分,能否開發具有我國自主知識產權的基因工程新藥。更進一步,是要研究開發人參功能基因,闡明人參的遺傳機制與調控機理,聯合中科院相關研究所,幫助培育出優質、高產、抗逆的養殖新品種,進而從根本上解決人參‘質’、‘量’和‘病’的問題。”
在完成這些工作后,可能還要植物所的專家來“接棒”,借助其植物質資源庫方面的優勢,建立人參種質資源庫,為人參產業提供優質的種質資源;也可能還要生態所的專家加入,幫助解決人參病蟲害、種植環境優化等問題。
“這是一個全方位的院地合作。基因組序列的完成并不等于項目的結束,而是剛剛開始;我們還會聯合科學院的幾個研究所,共同攜手,更系統地為整個人參產業的上游提供整體的科技支撐,在科學源頭上下功夫。”于軍一再強調這次合作還是“現在進行時”,接受采訪并不是發布什么成果,而是呼吁更多方的合作和參與。
面向人參產業的“陣地戰”序幕剛剛拉開,人參產業的“科技突圍”篇章還在續寫……
標準DNA條形碼憑借通用引物適配性強和測序成本低等優勢,廣泛應用于生物多樣性保護與溯源等領域。針對近緣種、雜交頻繁及近期輻射演化的復雜類群,標準DNA條形碼因序列變異度有限,分辨率不足,難以滿足精準鑒......
美國肯塔基大學馬丁·加頓農業、食品與環境學院團隊利用一頭雌性騾子的DNA,繪制出迄今最完整的馬和驢參考基因組,使科學家能夠進一步解析過去難以測序和組裝的著絲粒、端粒等復雜DNA區域,為研究染色體功能、......
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......