人類肝臟與小鼠肝臟更接近，還是與人類心臟？

　　西班牙基因組調控中心的Alessandra Breschi通過鑒定多個物種各個器官的RNA-Seq圖譜，發現一些基因的表達是隨物種而變化，而另一些是隨器官類型而變化。她表示，那些隨物種而變化的基因更可能是看家基因。

　　在近日召開的2015冷泉港基因組生物學會議（The Biology Of Genomes）上，Breschi做了題為“Constraints in gene expression across tissues and species”的報告，展示了這一成果。她指出，小鼠及其他生物通常作為模式生物，但是并不清楚各個物種或各個器官之間的轉錄圖譜是否保守。

　　“人類肝臟是與小鼠肝臟更接近，還是與人類心臟？”Breschi問道。

　　為了探究這一點，她們聚焦了7個物種的6個器官，包括6,000個蛋白質編碼基因，有著一對一的同源基因。通過研究物種和器官的轉錄組變化，Breschi及其同事發現，大約四分之一的基因隨器官變化大，隨物種變化小；而另外四分之一則相反。

　　Breschi指出，那些表達水平隨器官而變化的基因驅動了進化限制，而隨物種而變化的基因則與組織定義相關。她還指出，那些在各個物種之間變化相對較大，而在器官之間變化較小的基因則可能是看家基因。

　　此外，Breschi及其同事發現，對于表達水平隨物種而變化的基因，其特點是外顯子水平和轉錄起始位點的序列保守性較低。同時，這些基因的轉錄起始位點上有著更多的CpG島。她們發現，在小鼠肝臟中，隨物種變化大的基因有著較高水平的啟動子甲基化，同時，這種影響似乎保留在各個器官類型中，包括小腦、心臟、腎臟和睪丸。

　　Breschi還指出，那些在各個器官之間變化相對較大，而在物種之間變化較小的基因則集中在與疾病和癌癥類型相關聯的基因。

　　研究人員認為，了解某個特定基因或一組基因的表達是在物種中保守，還是在器官中保守，這將有助于以模式生物為基礎的研究。

　　“解析基因表達的變化是很有必要的，能夠鑒定出那些隨組織而變化，但不隨物種而變化的基因，這時小鼠就能作為很好的研究模型，”報告摘要中指出。