“依托種質資源庫的植物DNA條形碼研究”取得階段性進展

　　4月20日，中科院組織有關專家對昆明植物研究所李德銖研究員主持的中國科學院大科學裝置開放研究項目“依托種質資源庫的植物DNA條形碼研究”的進展進行了評議。該項目從2009年開始運行，目前已取得下列階段性成果。

　　通過項目的實施，聯合了來自全國22個科研院所和高校的60余人的植物分類學研究集體，并依托西南野生生物種質資源庫的研究力量，完成了中國維管屬植物62目、273科、1217屬、5131種、17847個體，近60000個DNA條形碼的獲取與分析。項目已發表論文60余篇，其中在PNAS、Plos One、Genome、American Journal of Botany、Journal of Plant Research、Journal of Systematics and Evolution、Taxon、Planta Medica等國際刊物50多篇；國內核心期刊10篇；在Journal of Systematics and Evolution上組織出版“Plant DNA barcoding in China”專輯，有力地提升了我國在植物DNA條形碼研究的國際影響力。

　　項目組通過對主要來自中國的種子植物75科141屬1757種共約6286個樣本的4個DNA候選條形碼片段（rbcL, matK, trnH-psbA和ITS）引物通用性、序列質量和物種分辯率等的綜合分析，建議將ITS作為種子植物的核心條碼，同時強調了利用多個樣本取樣和不同遺傳方式的DNA片段開展植物DNA條形碼研究的重要性。研究結果以“中國植物條形碼研究團隊（China Plant BOL Group）”的集體署名發表在《美國國家科學院院刊》上。同期的評論性文章認為，該項工作將DNA序列數據納入植物物種水平分類和鑒定常規應用邁出了重要一步。項目組還分別為裸子植物和被子植物新開發2對matK條碼的通用引物。此外，開發并篩選出20余對適合蘭花常見品種的SSR分子標記；測定了8種山茶屬植物的葉綠體全基因組序列，為基于葉綠體全基因組信息鑒定茶組植物奠定了基礎。

　　對保存在種質資源庫的野生種子利用DNA條形碼進行鑒定，通過對87屬274種的條碼數據的比較分析，發現了77種可能鑒定錯誤的樣品，為種質資源庫種子樣品的準確鑒定提供了有力的技術支撐。利用DNA條形碼技術，服務于司法、醫院、藥廠和大學等的相關部門提供的樣品的準確鑒定，取得了良好的社會效益。