傅立葉變換離子回旋共振質譜儀

傅立葉變換離子回旋共振質譜儀是一種高性能的高分辨質譜儀。亦可直接用FT-MS表示（Fourier-transform mass spectrometry）。它的核心部件是帶傅立葉變換程序的計算機和捕獲離子的分析室。分析室是一個置于強磁場中的立方體結構。

離子被引入分析室后，在強磁場作用下被迫以很小的軌道半徑作圓周運動，離子的回旋頻率與離子質量成反比，此時不產生可檢出信號。如果在立方體的一對面上（發射極）加一快速掃頻電壓，一對極板施加一個射頻電壓，當其頻率與離子回旋頻率相等時則發生滿足共振條件時，離子吸收射頻能量，運動軌道半徑增大，撞到檢測器產生可檢出信號。這種信號是一種正弦波，振幅與共振離子數目成正比。

實際使用中測得的信號是在同一時間內所對應的正弦波信號的疊加。這種信號輸入計算機進行快速傅立葉變換，利用頻率和質量的已知關系可得到質譜圖。傅立葉變換質譜儀具有很高的分辨率（可達100萬以上）和很高的靈敏度，但儀器價格和維持費用也很高。