全球首個血橙高質量基因組發布

5月19日，重慶市農科院發布消息，該院果樹所柑橘創新團隊楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發布了國際首個血橙高質量基因組。相關研究成果以學術論文近日在國際期刊《科學數據》發表。

楊蕾介紹，血橙是一種極具特色的甜橙品種，具有較高的花青素含量，其含有的多種成分對人體健康有益。目前，國內血橙主要在川渝地區種植，總種植面積超過100萬畝，其中重慶有40萬余畝。然而，現主栽血橙品種存在品質不穩定等問題。

血橙果實和基因組框架圖。重慶市農科院供圖

該團隊開展自主品種選育，發掘高糖高花青素芽變新資源“內秀”，其花青素含量更高，血色更深，糖度也更高。由于國際上尚未有公開發布的高質量的血橙基因組，團隊利用最新的第三代測序技術，對血橙芽變資源進行了全基因組測序，成功組裝了首個血橙高質量基因組，測序深度可達65X，基因組裝完整度評估為98.20%。團隊結合比較基因組學分析，揭示了血橙花青素合成能力的染色體結構變異基礎。

檢測分析表明，在中國西南地區，“內秀”在甜度和紅度方面都超過了當地主流品種“塔羅科”血橙，具有強大的市場潛力。此項科技成果將有力推動高品質血橙功能基因研究和基因組進化研究工作，并為后續血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。