成人患者：在最初14天，奈韋拉平的推薦劑量為每日1片，每片200 mg（這一導入期的應用可以降低皮疹發生率）。導入期后用法為每日2次，每次1片，并同時使用至少兩種以上的其他抗逆轉錄病毒藥物。對于那些合用藥，應遵循其推薦劑量并且應對這些藥物進行監控。
兒童患者：對于2個月到8歲的兒童，本藥的口服推薦劑量是用藥初始2周按4 mg/kg，一天1次給藥，之后為7 mg/kg，一天2次給藥。對于8歲和8歲以上的兒童患者，推薦劑量為初始2周按4 mg/kg，一天1次，之后為4 mg/kg，一天2次。任何患者每日用藥總劑量不得超過400 mg。
預防HⅣ母嬰傳播：對于將馬上分娩的孕婦，本藥的推薦劑量是口服單劑量200 mg，新生兒在出生后72小時內，按2 mg/kg單劑量口服用藥。
若患者在用藥期間出現嚴重皮疹或伴隨全身癥狀的皮疹，應該停藥。如果在導入期14天內，劑量為200 mg/天時出現皮疹，則患者的用藥劑量不再增加，直至皮疹消失。
如果患者出現中度或重度肝功能異常（不包括GGT），應停止使用奈韋拉平，直至肝功能恢復至基礎水平。之后，奈韋拉平應從200 mg/天重新開始給藥，進一步觀察，然后謹慎地增加劑量到200 mg/次，每日2次。如果再次出現中度或重度肝功能異常，奈韋拉平應該永久停藥。
如果患者停用奈韋拉平超過7天，應按照給藥的原則重新開始，即200 mg藥物，每日1次導入，之后每次200 mg，每日2次。
用藥過量尚無已知的奈韋拉平解毒藥。有報道過量使用奈韋拉平劑量每日800-1800 mg長達15天，患者出現水腫、結節性紅斑、乏力、發熱、頭痛、失眠、惡心、浸潤性肺炎、皮疹、眩暈、嘔吐和體重下降。在停用奈韋拉平后均好轉。