1． 針對基礎病因治療
對基本病因明確的膽汁淤積，如有可能均應力爭根治或控制基礎疾病。如腫瘤、結石所致的梗阻，可通過手術根治性腫瘤切除或ERCP取石；修復膽道狹窄則可使膽道引流恢復正常；對膽小管的免疫性損傷，免疫抑制劑可能有效；對藥物性膽汁淤積，及時停用有關藥物。
2． 支持與對癥治療
熊去氧膽酸、多烯磷酯酰膽堿膠囊、腺苷蛋氨酸、苯巴比妥。中藥制劑有利膽退黃、降酶作用，如柴胡、白芍、茵陳、丹參等；瘙癢的治療，可補充脂溶性維生素、鈣和維生素D。
3． 肝移植
某些類型終末期膽汁淤積疾病如原發性膽汁性肝硬化（PBC）、原發性硬化性膽管炎（PSC）、膽道閉鎖患者，其1年生存率約90%。