蛋白質結構是指蛋白質分子的空間結構。蛋白質主要由碳、氫、氧、氮等化學元素組成,是一類重要的生物大分子,所有蛋白質都是由20種不同氨基酸連接形成的多聚體,在形成蛋白質后,這些氨基酸又被稱為殘基。
蛋白質和多肽之間的界限并不是很清晰,有人基于發揮功能性作用的結構域所需的殘基數認為,若殘基數少于40,就稱之為多肽或肽。要發揮生物學功能,蛋白質需要正確折疊為一個特定構型,主要是通過大量的非共價相互作用(如氫鍵,離子鍵,范德華力和疏水作用)來實現;此外,在一些蛋白質(特別是分泌性蛋白質)折疊中,二硫鍵也起到關鍵作用。為了從分子水平上了解蛋白質的作用機制,常常需要測定蛋白質的三維結構。由研究蛋白質結構而發展起來了結構生物學,采用了包括X射線晶體學、核磁共振等技術來解析蛋白質結構。
一定數量的殘基對于發揮某一生物化學功能是必要的;40-50個殘基通常是一個功能性結構域大小的下限。蛋白質大小的范圍可以從這樣一個下限一直到數千個殘基。估計的蛋白質的平均長度在不同的物種中有所區別,一般約為200-380個殘基,而真核生物的蛋白質平均長度比原核生物長約55%。更大的蛋白質聚合體可以通過許多蛋白質亞基形成;如由數千個肌動蛋白分子聚合形成蛋白纖維。
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