10月6日,中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)研究員陳玲玲在《自然-方法》(Nature Methods)上,發表了題為Towards higher-resolution and in vivo understanding of lncRNA biogenesis and function的主題評論,重點論述了新技術的應用為長非編碼核糖核酸(RNA)研究帶來的前沿進展及挑戰。
近年來,隨著RNA測序技術的發展與應用,哺乳動物體內超過10萬條長非編碼RNA被發現,并以細胞和組織特異、時空和亞細胞分布特異等形式存在,參與調控基因表達。研究手段和技術的進步在一定程度上提升了對長非編碼RNA的認知,然而對長非編碼RNA生命周期與功能機制的全方位解碼尚未完成。在論述中,該論文以“我(長非編碼RNA)是誰,我何時被轉錄,我定位于何處,我如何工作,我干了什么”的角度,從長非編碼RNA生成、定位與功能;長非編碼RNA相互作用因子、結構與劑量效應;長非編碼RNA缺失的生物學表型三個方面解讀研究手段進步拓展了對長非編碼RNA功能的認知。同時,該文也指出長非編碼RNA分子天然的柔性、折疊和結構的異質性給相關研究帶來挑戰,并提出第三代長讀碼RNA測序技術、超高分辨率顯微成像技術、基于基因編輯和堿基編輯器技術等的發展為長非編碼RNA研究帶來的新機遇,為相關研究提出新方向。
研究工作得到中科院、上海市及國家自然科學基金等的支持。
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