如果想繪制出蛋白質最微小的部分,科學家通常選擇不多:使數百萬個單個蛋白質分子排列成晶體,然后用X射線晶體學分析它們;或者快速冷凍蛋白質的副本,然后用電子轟擊它們,這是一種低分辨率的方法,叫做冷凍電鏡技術。
據《科學》報道,現在,科學家們第一次將冷凍電鏡的分辨率提高到原子水平,以精確定位各種蛋白質中單個原子的位置,其分辨率可與X射線晶體學相媲美。
“看到這種程度的細節太不可思議了,它十分美麗。”美國密歇根大學安娜堡分校冷凍電鏡技術專家Melanie Ohi說。更佳的分辨率準確揭示了復雜的細胞機器是如何工作的,這意味著冷凍電鏡的改進可能會給生物學帶來無數新見解。
為了繪制蛋白質結構圖,科學家從20世紀50年代末就開始使用X射線晶體學。借助X射線轟擊結晶化的蛋白質,并分析X射線的反彈方式,科學家可以計算出蛋白質可能的構成和形狀。幾十年來,X射線束、探測器和計算機能力的改進使這種方法變得快速而準確。
但是,當蛋白質特別大、在核糖體等復雜的環境中工作或者不能結晶時,這種方法就不能很好地發揮作用。
研究人員使用冷凍電鏡對不需要結晶的冷凍蛋白質副本發射電子,探測器記錄電子的偏移,精密的軟件將圖像“縫合”在一起,也可計算出蛋白質的組成和形狀。
此前,日本的研究人員已經表明,他們可以將一種叫作去鐵鐵蛋白的腸道蛋白質的分辨率縮小至1.54埃——這還沒有達到可以區分單個原子的程度。
現在,在電子束技術、探測器和軟件進一步的幫助下,來自英國和德國的兩組研究人員已經將分辨率縮小到1.25埃或更小。10月21日, 他們在《自然》上報告說,這已經足以計算出單個原子的位置。
增強的分辨率或使更多的結構生物學家選擇使用冷凍電鏡技術。目前,這項技術只適用于異常堅硬的蛋白質。下一步,研究人員將努力在剛性較小、較大的蛋白質復合物(如剪接體)中達到類似清晰程度的分辨率。
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