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  • 發布時間:2019-09-13 12:15 原文鏈接: 加入接頭實驗

               

    試劑、試劑盒

    10 mol L ATP PNK (9.3 U ul) 5 x T4 DNA 連接酶緩沖液 LoTE

    實驗步驟

    1.稀釋引物IB和2B, 至質量濃度為350ng/V。

    2.加入下列試劑進行引物5’末端磷酸化:

    3.在37℃ 下孵育30 min。

    4.在65℃ 下放置 10 min熱失活PNKo

    5.將36ul 的引物IA加入到80ul磷酸化的引物1B中,同樣加36ul引物2A到磷酸化的2B(終濃度為217ng/ul)。

    6.使引物退火:先加熱到95℃,保持 2 min, 隨之在65℃ 下放置lOmin,在37℃ 下放置 10 min, 再在室溫下放置20 min。

    注意:可先取200ng接頭進行試連接,然后進行12% 聚丙烯酰胺凝膠電泳。如果磷酸化是成功的,大多數接頭(>70%) 應連接成為二聚體(±80bp)。

    實驗方案 A

    1.將接頭 1 連接到一份結合于 Dynabeads 上的已被 NlaIII 酶解的 cDNA,接頭 2 則連接于另一份。在冰上操作加入下述物質:

    2.加熱到 50C, 保持2 min, 然后在室溫下放置15 min,使接頭與 MaIII 酶解的 cDNA 退火。

    3.加入 2ul T4 DNA 連接酶(5U/ul), 然后在 16°C 連接接頭 2 h。

    4.在接頭連接完成后,用 2004 的 IX 結合及沖洗緩沖液沖洗磁珠 4 次,再用 200ul 的 1X 限制性緩沖液沖洗 2 次。

    5.完成最后一步沖洗后,固定磁珠并移去 LoTE。

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