動物組織中DNA的制備

（一）原 理
DNA是所有生物體的基本組成物質。真核生物DNA主要存在于細胞核中。制備DNA時應將細胞核膜打破方能釋放出來。
細胞中的DNA和RNA分別與蛋白質相結合，形成脫氧核糖核蛋白及核糖核蛋白。在細胞破碎后，這兩種核蛋白將混雜在一起。因此，要制備DNA首先要將這兩種核蛋白分開。已知這兩種核蛋白在不同濃度的鹽溶液中具有不同的溶解度，如在0.15mol/L NaC1的稀鹽溶液中核糖核蛋白的溶解度最大，脫氧核糖核蛋白的溶解度則最小（僅約為在純水中的1%）；而在l mol/L NaCl的濃鹽溶液中，脫氧核糖核蛋白的溶解度增大，至少是在純水中的2倍，核糖核蛋白的溶解度則明顯降低。根據這種特性，調整鹽濃度即可把這兩種核蛋白分開。因此，在細胞破碎后，用稀鹽溶液，反復清洗，所得沉淀即為脫氧核糖核蛋白成分。

分離得到的脫氧核糖核蛋白，用十二烷基硫酸鈉（SDS）使蛋白質成分變性，讓DNA游離出來，再用含有異戊醇的氯仿沉淀除去變性蛋白質。最后根據核酸只溶于水而不溶于有機溶劑的特點，加入95%的乙醇即可從除去蛋白質的溶液中把DNA沉淀出來，獲得產品。
當細胞破碎時，細胞內的脫氧核糖核酸酶（DNase）立即開始降解DNA，如果在破碎細胞后不及時采取抑制酶活的措施，最后將會得不到任何DNA。為此，如在本實驗中加入檸檬酸鹽、EDTA等螯合劑以除DNase必需的Mg2＋離子，使DNase活性降低，并要求整個分離制備的過程均在4℃以下進行，以減少DNase的降解作用，最后加入SDS使所有的蛋白質（包括DNase）變性。當然如果希望獲得更大分子的DNA時，則在細胞破碎后，及時加入SDS使蛋白質（包括DNase）變性，并加入蛋白酶K，降解所有的蛋白質成為碎片或氨基酸，及時阻止DNase的降解作用。

DNA分子很大、很長，在水中呈黏稠狀，但DNA鏈的雙螺旋結構不宜小角度的折疊，使之DNA分子具有剛性，即分子是僵直的（stiff），小角度的折疊和壓擠等剪切力，將使DNA斷裂成碎片。為保證獲得大分子DNA，操作時應避免急裂振搖，或過大的離心力。轉移吸取DNA時不可用過細的吸頭，不可猛吸猛放，更不能用細的吸頭反復吹吸。
大分子DNA的水溶液呈黏稠狀，可以用玻璃棒纏起來。液體DNA只要防止DNase污染和高鹽濃度條件下能在液體狀態保存；抽干后的固體DNA，性質穩定，可長期保存。
生物體內各部位的DNA是相同的，但取材時以含量豐富的部位為主，如動物的肝臟、脾、腎、血液、精子等。所有材料，必須新鮮及時使用，或放入－20℃冰箱或液氮冷凍保存。
DNA的含量及純度可用紫外吸收法、定磷法及化學法等測定。
（二）試劑及器材
（1） 0.15mol/L NaCl – 0.015mol/L pH7.0檸檬酸鈉溶液：稱取8.77g NaCl，4.41g檸檬酸三鈉（Na3C6H507 · 2H20），用約800ml蒸餾水溶解后，調節pH至7.0，最后定容至1 000ml。
（2） 0.15mol/L NaCl – 0.1mol/L EDTANa2溶液：稱取8.77g NaCl，37.2g EDTANa2溶于約800ml蒸餾水中，以NaOH調pH至8.0，最后定容至1 000ml。

（3） 5%（W/V）十二烷基硫酸鈉（SDS）溶液：稱取5g SDS溶于45%（V/V）100ml的乙醇中。
（4） 氯仿– 異戊醇溶液：按氯仿:異戊醇=24:1配制。
（5） pH8.0 TE緩沖液或0.01mol/LNaOH：120mol/L Tris–HCl，lmol/L EDTANa2。或取NaOH 0.4g加蒸餾水至1 000ml。
（6） 95％（V/V）乙醇1 000ml。
（7） 75％（V/V）乙醇1 000ml。
（8） 組織搗碎機。
（9） 玻璃勻漿器。
（10） 冷凍離心機。
（11） 冰、粗鹽。
（三）操作
（1） 本實驗以兔肝臟作材料（其他動物肝臟也可以）。實驗前應將兔饑餓24h以上，以避免糖原的干擾。
（2） 用燒杯（500m1）放1/3體積的冰，加入少量水及約20g食鹽，制成冰鹽水。
（3） 將經過饑餓的兔頸部放血致死，迅速開腹取出肝臟，稱取約10g浸入預先在冰鹽水中冷卻的0.15mol/L NaCl–0.015mol/L檸檬酸鈉溶液中。除去脂肪、血塊等雜物；再用少量溶液反復洗滌幾次，直至組織塊無血為止。
（4） 將洗凈的組織剪成碎塊。先加入20m1 0.15mol/L NaCl–0.015mol/L檸檬酸鈉溶液，放在組織搗碎機中迅速搗成勻漿，再放入玻璃勻漿器中勻漿2～3次，使細胞充分破碎。最后加入0.15mol/L NaCl–0.015mol–L檸檬酸鈉溶液至50ml。
（5） 勻漿液在4℃ 6 000r／min離心15min，棄上清。在沉淀中加入4倍體積冷的0.15mol/L NaCl–0.015 mol/L檸檬酸鈉溶液，攪勻，按上述條件，離心棄上清。如此重復操作2～3次，盡量洗去可溶的部分（目的是什么?）。最后棄去上清，留沉淀。
（6） 將沉淀物（約5m1）懸浮于5倍體積的pH8.0，0.015 mol/L NaCl–0.1 mol/L EDTANa2溶液中，攪勻，而后邊攪拌邊慢慢滴加5%SDS溶液，直至SDS的最終濃度達1%為止（應加多少毫升?），此時溶液變得十分黏稠，若不黏稠應重做，然后，加入固體NaCl使最終濃度達l mol/L。繼續攪拌30～45min，以確保NaCl全部溶解，此時可見溶液由稠變稀薄。
（7） 將上述混合溶液倒于一個300ml的帶塞三角瓶中，加入等體積的氯仿– 異戊醇，振蕩10min。在室溫3 000r/min離心10min（為什么可以在室溫操作?），此時可見離心液分為3層：上層為水溶液，中層為變性蛋白塊，下層為氯仿– 異戊醇。小心吸取上層水相，記錄體積，放入三角瓶中，向水相中，再加入等體積氯仿– 異戊醇，振蕩，離心，如此重復抽提2–3次，除凈蛋白質。
（8） 最后1次離心后，小心吸取上層溶液（不要吸取下層氯仿），記錄體積，放入干燥小燒杯中，加入2倍體積預冷的95%乙醇。加時，用滴管吸取乙醇，邊加邊用玻璃棒慢慢順一個方向在燒杯內轉動，隨著乙醇的不斷加入可見溶液出現黏稠狀物質，并能逐步纏繞于玻璃棒上，此時玻璃棒攪動的目的在于把黏稠絲狀物纏在玻璃棒上，直至再無黏稠絲狀物出現為止。黏稠絲狀物即是DNA。
（9） 將所得的DNA從玻璃棒上取下，用75%乙醇洗2次，置于干燥器中抽干，稱取重量，計算產率。
（10） 按200μg/ml的濃度稱取一定量DNA，溶于0.01 mol/L NaOH溶液或pH8.0 TE緩沖液中（干燥DNA不易溶解，應在測定前幾天預先溶解）。