近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志在線發表,并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas、犬類數據庫iDog、RNA編輯與疾病相關知識庫EDK、植物RNA編輯數據庫PED、人類長非編碼RNA數據庫LncBook、多物種全基因組核小體定位圖譜數據庫NucMap以及一篇介紹大數據中心整體資源建設進展的文章。
自成立以來,BIGD面向我國人口健康和社會可持續發展的重大戰略需求,圍繞國家精準醫學和重要戰略生物資源的組學數據,建立了針對原始數據遞交、存儲與共享的數據庫GSA,基因組變異數據庫GVM,基因組歸檔數據庫GWH,基因表達數據庫GEN,DNA甲基化數據庫Methbank,基于維基的生物學知識庫Science Wikis,大數據挖掘與分析的工具和方法的數據庫Biocode。在完成了基礎數據庫資源建設之后,又進一步開發了LncBook、EWAS、EDK、PED等一系列針對不同研究領域的專業數據庫。這些特色數據庫的建設完成將更有助于生物大數據的利用與轉化,真正實現了BIGD將數據存好、管好、用好的目標。
核酸研究期刊每年發布一次全球數據中心整體建設情況,自2016年至今,連續三年發布北京基因組所生命與健康大數據中心資源建設情況,并在今年一月的數據庫專刊中將該中心評價為國際重要數據中心之一。

大數據中心資源
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
據統計,超過50%的上市小分子藥物均直接或間接源自天然產物或其化學結構啟發。這些由植物、動物、微生物在億萬年進化中淬煉出的天然分子,擁有人工合成難以企及的復雜結構與強大生物活性,是創新藥物發現的源泉。......
近日,寧波市土壤生物普查項目通過專家驗收,標志著浙江省首個市級土壤生物數據庫正式建成。該項目由寧波大學牽頭,聯合中國科學院城市環境研究所、武漢工程大學共同完成,系統摸清了寧波市土壤生物"家底......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......