華人學者推出CRISPR新設計工具

　　細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗爭，為此它們演化出了多種防御機制，CRISPR/Cas適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合，可以在引導RNA的指引下，靶標并切割入侵者的遺傳物質。

　　2012年研究者們利用這一特點，將CRISPR系統發展成了強大的基因組編輯工具。該系統使用簡單而且擴展性強，很快便成為了生物學領域的香餑餑。2015年基因組編輯熱潮在持續發酵，CRISPR/Cas9仍舊是最引人注目的話題之一，相關論文被大量下載和引用。

　　然而CRISPR/Cas9系統的應用還存在一個很大的問題，那就是缺乏設計引導RNA（sgRNA）的有效生物信息學工具。為了解決這一迫切的需要，華盛頓大學的王小偉（Xiaowei Wang）博士領導研究團隊揭示了功能性引導RNA的特點，為人們提供了設計引導RNA的新工具。這一成果發表在十一月二日的Genome Biology雜志上。

　　幾乎所有實驗室都可以很方便的進行CRISPR基因組編輯，你只需要在自己感興趣的細胞或生物中表達Cas9內切酶和引導RNA（gRNA）。內切酶Cas9會在gRNA的指導下引入位點特異性的雙鏈斷裂，然后細胞通過同源重組進行修復，最終改寫基因組的特定位點。（延伸閱讀：Nature Biotechnology：CRISPR再獲重要改良）

　　研究人員對CRISPR RNA-seq數據進行分析，鑒定了許多代表高效sgRNA的新特征。他們在此基礎上開發了一個生物信息學工具，可以幫助研究者們設計更加有效的sgRNA。這些sgRNA和設計工具可以在WU-CRISPR網頁上免費獲取。