單核RNA測序的芯片現已上市

　　高通量的單核RNA測序方法——DroNc-Seq才剛剛在《Nature Methods》上發表。一轉眼，相應的芯片已經上市。Dolomite Bio公司針對DroNc-Seq推出一款新的芯片，可實現高通量的單核RNA-Seq分析。

　　DroNc-Seq方法在Broad研究所的張鋒（Feng Zhang）和Aviv Regev領導下開發。它融合了單核RNA測序方法sNuc-Seq和微流體技術，能夠對結構復雜組織的基因表達進行大規模的并行測定。（延伸閱讀：張鋒團隊開發出高通量的單細胞RNA測序方法）

　　在各種分辨率都迅速升高的今天，一大團細胞的研究結果顯然不能滿足人們的需求。通過單細胞RNA-Seq分析，研究人員能夠了解腫瘤異質性和克隆演化，比如研究癌癥干細胞、了解耐藥性等。他們也可以了解復雜的組織，如大腦中各種類型的神經細胞。

　　然而，對某些樣本而言，分離單細胞的過程很漫長，會影響基因表達譜，也不能準確反映細胞類型的真實比例。作為一種新穎的單細胞分析方法，DroNc-Seq使用分離的細胞核，而不是整個細胞。細胞核可快速輕松地從冷凍組織中分離。值得一提的是，所獲得的轉錄組與來自全細胞的轉錄組很相似，不過細胞核RNA和pre-mRNA的比例略高。

　　Dolomite Bio之前推出了一款scRNA-Seq芯片，可實現低通量的單核RNA-Seq分析。如今，這家公司改進了scRNA-Seq芯片，以便生成更小的液滴，從而低成本、高通量地分析數千個細胞核。這款芯片很快將正式推出。

　　單核RNA-Seq芯片可以與Dolomite Bio的單細胞RNA-Seq系統兼容。這是一款基于微流體的系統，之前為Drop-seq應用而開發。它將帶有條形碼的mRNA捕獲珠、細胞裂解液以及數以萬記的單細胞分布在分散的液滴內。細胞在液滴中裂解，捕獲珠可以捕獲單細胞轉錄的mRNA，降低RNA酶的降解幾率，從而提高測序的準確性。