上海海洋大學教授陳良標、胡鵬團隊，在活體魚類胚胎中實現了單細胞新生RNA測序技術的系統優化和應用，首次實現對“合子激活”階段新轉錄基因的高靈敏度、高準確性檢測，打開了研究生命起源奧秘的新窗口，也為水產育種的基因精準設計提供了重要工具。相關研究近日發表于《自然-通訊》。
每個新生命的開始都經歷過一次“主權交接”，即從母親提供遺傳物質過渡到胚胎自主控制基因表達。這一過程被稱為“母源-合子轉換”，是胚胎發育中最關鍵的轉折點。然而，剛被激活的合子基因轉錄本數量極其稀少，常常被海量的母源RNA“淹沒”，使得傳統的測序技術很難“聽見”這些微弱卻至關重要的聲音。
研究團隊圍繞魚類胚胎模型，開展了系統性優化。通過對10種主流RNA化學轉化方法進行系統篩選，并在超過5萬個斑馬魚細胞中測試，研究團隊發現，基于mCPBA/TFEA 的“on-beads”轉化方案，能實現超過8%的T-to-C替換率，表現遠優于傳統“體內標記”方法。此外，研究人員在斑馬魚受精卵的一細胞階段顯微注射4-硫尿苷，實現了對合子新轉錄RNA的高效標記。
系列研究結果顯示，優化后的方法檢測靈敏度大幅提升，能在海量母源RNA背景下清晰捕捉新合子RNA信號，并精準區分母源和合子RNA。值得一提的是，研究團隊識別出多個此前未被報道的合子激活基因，并通過原位雜交實驗驗證了這些合子激活基因在整胚中的表達模式。
相關論文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-025-61375-z
上海海洋大學教授陳良標、胡鵬團隊，在活體魚類胚胎中實現了單細胞新生RNA測序技術的系統優化和應用，首次實現對“合子激活”階段新轉錄基因的高靈敏度、高準確性檢測，打開了研究生命起源奧秘的新窗口，也為水產......
上海海洋大學教授陳良標、胡鵬團隊，在活體魚類胚胎中實現了單細胞新生RNA測序技術的系統優化和應用，首次實現對“合子激活”階段新轉錄基因的高靈敏度、高準確性檢測，打開了研究生命起源奧秘的新窗口，也為水產......
在廣袤的農田里，水稻是人類重要的主食作物之一。然而，土壤鹽漬化這一全球性難題，正嚴重威脅著水稻的生長與產量。據聯合國糧食及農業組織相關數據顯示，全球至少10%的土地受到鹽漬化影響，這使得水稻在生長過程......
11月8日，中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所副研究員李雪飛團隊與香港浸會大學副教授田亮團隊展開合作的最新成果發表于《美國科學院院刊》。合作團隊開發了一種基于深度學習與公開單細胞數據集的解卷......
7月11日，腫瘤診斷領域的領先創新者PredicaDiagnostics與華大智造宣布達成合作，共同在華大智造高通量測序平臺上開發Predica的靶向RNA測序技術，助力精準醫療。此次合作旨在通過實現......
南方科技大學饒楓團隊與天津醫科大學趙麗團隊、北京生命科學研究所王鳳超團隊合作在腫瘤細胞葡萄糖感知與代謝調控通路研究領域取得新進展，研究成果以“葡萄糖誘導CRL4COP1-p53信號軸促進糖代謝以驅動腫......
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中，美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校（UCSC）的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。分析一個人的基因表達需要將他的R......
成體海馬神經發生（AHN）是否在成年和老年人中持續存在，至今仍然存在廣泛的爭議。其中關鍵問題是，在嚙齒類動物中發現的標記能否用于描述靈長類動物的神經發生仍存在疑問。北京師范大學研究團隊利用單細胞核RN......
為了確保單細胞RNA測序能夠使用最好的方法，日前研究人員對13種方法進行了基準性的測試，一項刊登在國際雜志NatureBiotechnology上的研究報告中，來自西班牙的科學家們通過研究發現，日本理......
近日，發表在《NatureCommunications》上的一項研究中，研究人員利用單細胞RNA測序深入了解了皰疹病毒，為預防皰疹感染帶來了新的見解。如果你的嘴唇開始刺痛發癢，通常意味著你將患上唇皰疹......