近日,著名國際期刊nature biotechnology發表了英國科學家的一項最新研究成果,他們應用單細胞基因表達分析與計算方法描述了血液發育的轉錄調控網絡。這項研究為分析器官發育的調控網絡提供了一種可行的方法。
研究人員指出,重建調控器官發育的分子途經受限于缺少對胚胎祖細胞進行研究的方法,他們提出一種策略,通過對大量單細胞基因表達進行基于降維的擴散映射數據分析和用狀態轉換圖合成數據網絡來解決這一難題。研究人員應用這一方法研究小鼠胚胎造血發育,對E7.0和E8.5之間四個時間點取的3934個具有血液形成潛能的細胞使用單細胞基因表達分析,描述了中胚葉向血液方向分化的過程。然后將個體細胞狀態轉化用作輸入信息形成單細胞網絡合成工具,來建立一個針對血液發育的計算執行轉錄調控網絡模型。研究人員應用幾個模型預測Sox和Hox因子作用的結果都得到了實驗驗證。
綜上所述,該文章應用單細胞基因表達分析和計算方法描述了血液發育的調控網絡,表明單細胞分析結合計算方法描述器官發育能夠揭示器官發育的轉錄調控網絡。
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