試劑、試劑盒 溶液與緩沖液LoTEcDNA標簽
實驗步驟
實驗方案 A 和 B
一、連接混合物的 PCR 擴增
1.加入 LoTE 使連接混合物的體積增至 20ul。
2.按 1% 濃度稀釋連接混合物。
3.在 50ulPCR 反應中以 Iul 的 1% 稀釋后的連接混合物作為模板:
4.最后,在 PCR 的反應中加入 1ul 稀釋的連接混合物作為模板。
5.用下列條件來進行 PCR 擴增:
在進行 PCR 擴增后,在 12% 聚丙稀酰胺凝膠上電泳分析 IOul 的 PCR 混合物,用一個 IOul 的 ladder 作為標志,我們推薦用 Mini-PROTEANII 垂直電泳系統進行電泳 (BioRad)。
二、大量 PCR 的純化(n=IOO)
1.在稀釋的連接混合物大量地擴增之后(100XIOOul 的 PCR 反應),在 100 ml 的燒杯中混合(混合體積為 10 ml 左右)。
2.50 ml 的 PB 緩沖液(QIAquickPCR 純化試劑盒)于稀釋的 PCR 混合物中,混勻。
3.向 16 個 QIAquick 柱中,每個加入 600ul。
4.在微量離心機中以 13000r/min 離心 45s。
5.移去過濾液并用同一柱重復 5 次,每次均加入稀釋的 PCR 混合物 600ul。
6.在移去最后 1 次過濾液后,離心 1 次以去除所有的液體。
7.用 0.75 ml 緩沖液 PE 沖洗(QIAquickPCR 純化試劑盒)。
8.以 13000r/min 在微量離心機中離心 45s。
9.棄去流過的液體,并再全速旋轉 Imin 以去除所有的液體。
10.將此柱置入一干凈的 1.5 ml 的 Eppendorf 試管中。
11.一個柱中加入 30ul 的洗脫緩沖液(QIAquickPCR 純化試劑盒)。
12.在室溫下放置 15 min。
13.以 13OOOr/min 在微量離心機中離心 Imin 以洗脫 DNA。
14.將 16 柱洗脫的 DNA 混合入一個試管中(總體積為 480ul)。
PCR擴增后一般進行瓊脂糖凝膠電泳分析,電泳后一般有以下幾種條帶:1、引物帶。引物濃度過高或是擴增效率不是特別高時都會有,一般不呈現為細帶,為發散狀;如果目的擴增產物帶和引物帶都很亮,可以考慮適當降低......
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