只需100個細胞的表觀基因組分析

　　近年來，表觀遺傳學已經成為了干細胞分化、炎癥、癌癥等多個領域的研究熱點，但它在臨床上的潛力還未得到充分挖掘。表觀基因組分析可以幫助醫生根據患者的自身狀態調整治療方案，最終實現個性化醫療。問題在于，表觀基因組分析需要的細胞量很大。舉例來說，檢測全基因組的蛋白-DNA互作和染色質修飾大約需要一千萬細胞，對患者樣本進行這樣的分析基本是不可能的。

　　 弗吉尼亞理工學院的Chang Lu教授十多年來一直致力于開發活細胞分析工具，以便更好的理解人類疾病。他擅長用微流體裝置檢測細胞內發生的分子事件。

　　 最近Lu教授與愛荷華大學的Kai Tan合作，在Nature Methods雜志上發表了突破性的研究成果。他們基于微流體裝置開發了MOWChIP-Seq（microfluidic oscillatory washing based chromatin immunoprecipitation）技術，只需要100個細胞就能進行表觀基因組分析。

　　 “我們使用的微珠填充層，可以高效率的收集染色質片段。有效清洗不需要的分子，確保了目標分子的純度。因此，MOWChIP-Seq分析表觀基因組有著極高的靈敏度，”Lu說。

　　 常規ChIP實驗要花好幾個小時，但MOWChIP只需90分鐘就可完成。研究人員用這一技術對小鼠胎兒肝臟中的造血干細胞和造血祖細胞進行了研究，揭示了早期造血作用中的增強子動態。

　　 “過去我們并不了解早期造血過程中的表觀基因組變化，因為很難分離到足夠進行分析的細胞。我們開發的新技術很好的解決了這個問題，”Tan解釋道。

　　 “在這一技術的基礎上，人們只需要很少的細胞就可以進行表觀基因組研究，”Lu說。下一步，研究人員打算用MOWChIP-Seq技術研究與炎癥和癌癥有關的表觀基因組改變。