基因測序為你揭開埃博拉病毒的秘密

　　2014年6月，西非埃博拉病毒爆發初期，一組研究人員以空前的規模和速度迅速破譯了這一致命病毒的基因組。他們的發現揭開了病毒擴散過程中大量的關鍵性問題，包括病毒只通過人與人相互接觸的方式傳播并通過大量傳播產生新變異。

　　雖然目前公共衛生官員們相信病毒最危險的階段已經過去，事實上一切還尚未結束，先前研究工作中提出的許多問題仍然有待解答。為了解答這些問題，一個全球性的團隊，其中包括來自哈佛大學（Harvard University）、博德研究所（ the Broad Institute）、美國疾病防控中心（the U.S. Centers for Disease Control and Prevention ）、過敏和傳染病國家研究所（the National Institute of Allergy and Infectious Diseases，NIAID，國家衛生研究院的一部分）的人員，以及許多其他研究所的研究人員，對200多個額外埃博拉病毒樣本的基因組進行了測序，力求獲得目前為止最完整的信息，以此確定病毒的傳播方式以及病毒長期爆發過程中發生了哪些變化。

　　為了在全球范圍內引起關注，研究團隊向外界公布了他們去年一整年研究獲得的第一手數據。該研究的主要作者Pardis Sabeti說：這種數據共享帶給我們的最大益處在于，它將如此多的杰出專家組織到了一起，共同應對病毒的挑戰。

　　領導作者Danny Park說：我們從這些高分辨率測序中洞悉到一點，即在爆發以后，病毒的跨國境傳播非常少。這一點非常重要，因為三個主要感染國家的邊境塞拉利昂、利比里亞和幾內亞被說成是破碎國境（porous borders），使得人們可以頻繁往返。

　　雖然跨境接觸可能引起前期爆發的擴展，但Park表示，目前明確的是，疫情一旦發生病毒不會按許多人預測的途徑遷移。令人異常欣慰的是，將爆發控制在境內的措施將會起作用，這使人們得以將注意力集中在國內。

　　新的測序還能為持續爆發中病毒的進化提供見解。在爆發早期病毒迅速擴散，并累積許多突變，突變比例失調會影響蛋白功能。去年8月，研究人員注意到大多數突變都可能損傷病毒，但是爆發持續的時間還不夠長，無法通過自然選擇為其去蕪存菁。

　　長期而言，研究團隊觀察到許多突變并沒有長期存在，病毒基因組的變化率比長遠預期的高。Park 說：埃博拉病毒從未在人類面前暴露如此長的時間，并且通過這么多次的轉化，已經開始去除掉了對其自身不利的突變。

　　研究團隊還證實了其他長期預期會發生的改變。例如，在一些患者身上，研究人員發現了人體酶編輯病毒基因組的證據。這種現象在埃博拉病毒中從未發生過，此前僅僅在與人類長期接觸的病毒上看到過。

　　Sabeti說：在病毒爆發早期我們看到的許多突變以及長期的進化，之前在其他病毒上都觀察到過。并且這些基因組數據僅能幫助闡明進化現象。這些數據只是提醒我們（就像我們所熟知那樣），我們必須將這種病毒化為烏有。