隨著大規模的DNA結果越來越多的可供病人和保健提供者使用,醫學界在醞釀著一次平靜的轉換。在一連串的數據當中,醫生、顧問和家庭正在梳理如何更好地理解這些信息,并將其用于醫療決策的制定。
最近,在兩大兒科醫院舉行的臨床遺傳學會議上,來自多家機構的專家提出了他們對于“基因組整合到臨床實踐”的第一份建議。這些建議發表于 Nature子刊《Genetics in Medicine》,是由費城兒童醫院個性化醫學遺傳學中心主任Ian D. Krantz博士,和多倫多病童醫院遺傳醫學中心Ronald D. Cohn共同指導完成。
臨床遺傳學家Krantz說:“隨著基因檢測變得更加復雜,它正被應用在更多的醫學專業和初級保健中。這些測試將廣泛用來篩選健康的人群,并且我們的建議旨在幫助人們更好的將測試結果整合到臨床實踐中。”
Krantz和共同作者、多倫多大學病童醫院遺傳醫學中心的Sarah Bowdin博士,是兩個臨床遺傳學智囊團的帶頭人。這篇論文的共同作者還包括智囊庫的其他參與者:臨床遺傳學家、遺傳咨詢師和實驗室專業人員和生物信息 學專家。Krantz說:“我們的合作者代表了這個領域的主要利益相關者。我們還將患者及其家長列入智囊團,將他們的經驗納入這些問題的日常處理。”
Krantz補充說,他和Bowdin聽說,同事們在臨床基因組學和外顯子組測 序項目中遇到了與其他機構一樣的問題,于是就發起了這個智囊團。這些挑戰是,如何最好地解釋DNA結果?如何向患者和臨床醫生報告關于不確定的基因變異的 信息?如何報告與測試主要原因無關的二次結果?以及如何與其他中心共享這些結果。“因為每個機構都各自開發了自己的程序,所以我們認為,在我們的領域交換 經驗,可以提高整體實踐能力。”
這些建議提出了事前測試(包括選擇病人和獲得保險范圍)、病人和醫生教育,解釋序列數據,以及后續測試病人護理(包括如何返回測試結果,并提供數據 的重新評估)。Krantz補充說,另一個廣泛的領域是表現型——為病人的臨床特點建立一致的術語,這樣,臨床醫生就可以更好地解釋DNA結果的意義,在 各中心之間共享數據,并最終規范化病人的護理。
Krantz將這些新的挑戰與更直接的臨床狀況進行了比較。相比之下,目前臨床基因組和外顯子組測序產生了許多未知數:對于每個個體來說,測試結果產生了許多具有不確定意義的變異,以及二次發現——與病人基本條件無關的基因變異。
面對大量的DNA數據,一些家庭告訴其他智庫參與者,他們往往首選兩個延時測試,以討論測試結果——一個是得到主要的診斷結果,另一個測試是討論醫學上可操作的二次結果。
Krantz補充說,至關重要的是,來自基因測試的數據是動態的——隨著新的科學知識積累,數據的意義發生變化:一些不確定的研究結果,將變得更清 楚,并在未來將成為醫學上可操作的,所以,醫療服務提供者需要設計某種方法,系統地給病人的基因組提供重新評估。他說:“我們需要讓這些數據成為縱向的, 而不是靜態的。”
智囊庫提出的一個新興問題是,如何最好地將基因組結果整合到每個病人的電子健康記錄中。Krantz說,這變得更加重要,因為臨床測序可用于健康患者群體的一般檢查,包括新生兒,可作為精密醫學發展的一部分。
Krantz補充說,跟一個家庭的對話,幫助他們理解了這個問題。他解釋了一個具有多種醫學問題的孩子的基因測試結果。意想不到的二次結果發現,這個孩子攜帶一個癌癥易感性基因,了解這種情況之后,孩子父母詢問是否可對他們的健康孩子進行檢測。
Krantz說:“我們制定這個文檔,并不是一組公開的指導方針,而是作為建議,我們希望,隨著我們這個領域的發展,會有所改變。”他補充說,未來智囊團將開會討論新的挑戰。
基因組學在醫學領域發揮了重要的作用。2014年12月,一項研究公布了針對超過100個患有廣泛神經功能和發育障礙的兒童的家庭,進行基因組測序分析的大規模研究成果,這一成果公布在Science Translational Medicine.雜志上。
隨著癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas)的完成,現在是評估其影響和挖掘數據的時候了,以對癌癥生物學和治療獲得更好的了解。2015年2月5日,《自然醫學》(Nature Medicine)發表題為“The future of cancer genomics”的社論文章,對該項目對癌癥研究領域的影響及數據挖掘進行了評估。
2015年12月,國際著名學術期刊《Genome Biology》在線發表了斯坦福大學Matthew H Porteus教授的一篇評論文章。這篇文章回顧了基因組編輯的潛在治療價值、基因組編輯及其工具箱的發展,討論了非同源性末端結合介導的基因組編輯和同 源性重組介導的基因組編輯,可能具有的治療價值,以及生殖細胞系基因組編輯所面臨的挑戰。
標準DNA條形碼憑借通用引物適配性強和測序成本低等優勢,廣泛應用于生物多樣性保護與溯源等領域。針對近緣種、雜交頻繁及近期輻射演化的復雜類群,標準DNA條形碼因序列變異度有限,分辨率不足,難以滿足精準鑒......
美國肯塔基大學馬丁·加頓農業、食品與環境學院團隊利用一頭雌性騾子的DNA,繪制出迄今最完整的馬和驢參考基因組,使科學家能夠進一步解析過去難以測序和組裝的著絲粒、端粒等復雜DNA區域,為研究染色體功能、......
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......