基因組所肝癌全基因組合作研究取得新進展

　　近日，由中國科學院北京基因組研究所所長吳仲義及其科學團隊與國立臺灣大學醫學院陳定信院士、陳培哲院士共同合作開展的“肝癌癌癥基因組合作研究”計劃獲最新進展，相關學術論文在在最新出版的PNAS雜志上發表。

　　“肝癌癌癥基因組合作研究”計劃于2009啟動，作為基因組所一項長期的癌癥基因組合作研究計劃，其主要目的是分析腫瘤基因組序列改變，并通過其研究結果對獲得新的癌癥診斷治療方法起到積極的作用。經過2年的合作研究，該計劃已經獲得了越來越多的成果，同時對腫瘤的發生、發展有了更多新的認識。此次發表的學術論文則報告了該計劃的第一例肝癌全基因組最新研究成果。

　　目前，癌癥是人口死亡的第二大主因，如肝癌、肺癌、食管癌和胃癌的5年生存率均不超過30％，其中肝癌僅為5％-6％。癌癥死因主要是癌癥的轉移與復發，為此“癌轉移”已成為21世紀生命科學急需要解決的問題。肝癌是全球第三位癌癥殺手，在我國則居第二位，肝癌的治療以手術治療為主，但即使早期切除，5年內仍有半數患者轉移復發。近年來開展的肝癌局部治療，其轉移復發率比切除還要高，即使作肝移植，癌轉移復發仍然是首要問題。

　　癌細胞與正常細胞行為不一樣的遺傳因素是癌細胞基因組里有一些基因突變。隨著第二代測序技術在成本和數據產出上的巨大發展與突破，科學家們可以通過比較不同癌細胞和正常細胞的基因組，獲得癌細胞中發生突變的基因，同時也可以了解這些突變發生的先后順序，并結合演化的觀點更為直接地推斷腫瘤的演化過程。

　　在此次研究發現中，研究人員通過追蹤一例肝癌病人腫瘤細胞的DNA改變過程，對改例病例的原位以及肝內轉移腫瘤進行了全基因組測序，并鑒定該例病例中基因突變及其發生的先后順序。雖然腫瘤細胞通常積累了成千上萬的突變，通過演化的觀點分析研究人員界定出3個關鍵的基因突變，因為這3個突變均剛發生于腫瘤細胞群體迅速膨脹之前。

　　以往認為，復發腫瘤一般是由原位腫瘤細胞的后代發展而來，在這一例的研究中研究人員觀察的2個復發腫瘤的基因組發現，復發腫瘤1的確是原位癌的直接后代，而復發腫瘤2更像是原位癌的兄弟克隆，而非子代克隆。而這意味在原位癌獲得快速生長能力之前，腫瘤細胞就發生了轉移，這也豐富了人們對“復發腫瘤”的認識。

基因組所肝癌全基因組合作研究取得新進展