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  • 發布時間:2019-09-10 09:07 原文鏈接: 外源DNA片段在質粒載體中的克隆實驗

    • 克隆法

               

    實驗方法原理

    限制性內切酶可識別特定位點并切割DNA產生粘性末端或平端的外源片段,經DNA的純化處理后用于連接反應;選擇克隆載體pUC18多克隆位點上相應的限制性內切酶切割,并用堿性磷酸酶處理防止載體自連;在連接酶的作用下將外源片段連接到載體上,實現外源片段的克隆。

    實驗材料

    DNA片段 PUC18

    試劑、試劑盒

    R.E buffer 水 凝膠 氯仿 異戊醇 乙醇

    儀器、耗材

    離心機

    實驗步驟

    1.  載體pUC18和外源DNA片段的限制性酶切:
      50 &mu;l反應體系,用1.5ml tube,冰上操作)
      DNA           30 ul
      R.E           1 ul
      10xbuffer        5 ul

      ddH2O           14 ul


      外源片段酶切產物和5 ul 37 ℃反應1hr,分別取8 ul PUC18酶切產物于1.0%凝膠檢測酶切是否完全;按2-5步純化、回收DNA

      2.  加入ddH2O 150  (擴大體積),加入等體積氯仿/異戊醇(24:1),顛倒混勻,12000 g離心10 min;

      3.  吸取上清,加1/10體積3 M NaAc和兩倍體積無水乙醇,-20 ℃放置15分鐘以上;

      4.  12000 g 4 ℃冷凍離心15分鐘;

      5.  ddH2O(1.5 ml ddH2O(0.5 ml tube中),PUC18溶于20 ul 倒去上清,用75%乙醇浸洗沉淀,風干后外源DNA溶于10  tube中);

      6.  按以下反應去除載體PUC18的5'磷酸基團,50 ℃反應30 min 以上
      DNA                   20 ul

      CIAP(TaKaRa)        0.5 ul

      buffer              4.0 ′10 μl

      ddH2O               15.5 ul


      7.  70 ℃水浴10 min, 使CIAP失活;

      8.  按2-5步純化載體,溶于10 ul ddH2O;

      9.  連接反應
      DNA                10 ul
      pUC18            2.5 ul
      buffer           1.5 ′ 5 ul
      mT4 ligase   3 U/ul

      16 ℃水浴過夜

      10.  轉化大腸桿菌感受態細胞

      11.  轉化子的鑒定


                展開           
    注意事項

    1. DNA重組技術包括載體及外源DNA片段的酶切消化、目的片段的獲得及純化、目的片段與克隆載體的體外連接、重組子的篩選和鑒定等內容。


    2. 氯仿對眼睛、皮膚、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌劑并可損傷肝臟和腎臟,操作時需戴手套、安全鏡并在通風櫥中進行。苯酚是強腐蝕劑,能引起嚴重燒傷。操作時應戴手套、安全鏡、穿防護服,并在通風櫥中進行。

    其他

    1. 克隆中所用到的幾種酶:(1)限制性內切酶(2)堿性磷酸酶(3)連接酶(體外催化磷酸二酯鍵的形成可使用兩種酶:大腸桿菌連接酶和T4噬菌體連接酶),但幾乎在所有的克隆中T4噬菌體連接酶都是首選的酶,因其能在正常的反應條件下能有效的將平端連接起來。


    2. 載體的負載能力:即能克隆多大的DNA片段,是否有合適的限制性內切酶位點,酶切位點的性質,粘性或平末端,是否有選擇重組克隆的其它標記,如藍白斑篩選等。

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