中老年男性，長期嗜酒，有慢性支氣管炎或其他肺部疾病、糖尿病、惡性腫瘤、器官移植或粒細胞減少癥等免疫抑制，或建有人工氣道機械通氣的患者，出現發熱、咳嗽、咳痰、呼吸困難及肺部濕性啰音，血中性粒細胞增加，結合X線有肺部炎性浸潤表現提示細菌性肺炎時，均應考慮到本病的可能。
合格痰標本涂片找見較多革蘭陰性桿菌，尤其大量集聚在膿細胞和支氣管的假復層纖毛柱狀上皮細胞周圍并帶有莢膜者，更應考慮克雷白桿菌肺炎的可能，但不是確診依據。痰培養分離出肺炎克雷白桿菌有利于診斷，但應與定植于口咽部的污染菌相鑒別。連續兩次以上經涂片篩選的痰標本分離到肺炎克雷白桿菌或痰定量培養分離的肺炎克雷白桿菌濃度>106CFU/ml或半定量濃度為+++或++++，可擬診為肺炎克雷白桿菌肺炎。對重癥、難治或免疫抑制病例，使用防污染下呼吸道標本采樣技術如經環甲膜穿刺氣管吸引（TTA）、防污染雙套管毛刷采樣（PSB）、支氣管肺泡灌洗（BAL）和經皮肺穿刺吸引（LA）等，有助本病的確診。