近日,國際生物學期刊nature biotechnology在線刊登了美國科學家的一項最新研究成果,他們應用整合酶缺陷的慢病毒載體(IDLV)檢測CRISPR-CAS9和TALEN對基因組造成的脫靶效應,最低可檢測1%的脫靶頻率。這項研究或對推廣CRISPR-CAS9和TALEN技術,保證基因操作的準確性具有重要意義。
目前,CRISPR-CAS9和TALEN技術已經廣泛應用在基因操作平臺,但脫靶效應一直是科研人員應用這兩項技術面臨的最大擔心和問題,脫靶會造成基因組的不穩定并會擾亂正常基因的功能。在之前的一些工作已經發現一些方法可以預測篩選脫靶位點,但這些研究方法都不能在體內很好匹配體外的預測結果,因此如何提高預測的準確性,優化預測方法成為推廣應用CRISPR-CAS9和TALEN技術必須要解決的問題。
之前幾個研究小組已經報道,雙鏈IDLV能夠通過非同源末端連接的方法特異性插入到基因組雙鏈斷裂DNA上,這種策略使體內標記核酸酶產生的雙鏈斷裂DNA成為可能,并被用于檢測鋅指核酸酶的脫靶切割位點。因此,Xiaoling Wang等人將IDLV用于衡量CRISPR-CAS9和TALEN的脫靶活性。
綜上所述,該文章通過整合酶缺陷的慢病毒載體(IDLV)檢測了CRISPR-CAS9和TALEN的脫靶效應,并對這兩種技術的脫靶效應具有很高的檢測效率。這項技術的應用或為推廣CRISPR-CAS9和TALEN技術,保證基因操作的準確性起到重要推動作用。
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