張永振、石正麗團隊分別發表文章報道武漢新型冠狀病毒

　　2020年2月3日，上海公共衛生臨床中心、復旦大學公共衛生學院張永振教授團隊和中科院武漢病毒研究所石正麗教授團隊分別在Nature上發表文章A new coronavirus associated with human respiratory disease in China和A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin，報道了此次武漢新型冠狀病毒。

　　需要指出的是，張永振教授的文章是2020年1月7日Nature接收到，1月28日接受。石正麗教授的文章是2020年1月20日Nature接收到，1月29日接受。

　　張永振教授領導的團隊從1名在武漢海鮮市場上的工作人員身上收取到了支氣管肺泡灌洗液，鑒定出了一種新型病毒，利用測序技術確定了該RNA病毒的基因組（注：張永振教授是第一位公布該病毒序列的科研工作者，1月10日公布序列），并發現該病毒基因組與蝙蝠體內發現的SARS樣冠狀病毒有89.1%的相似性。該名工作人員于2019年12月26日在武漢一家醫院住院，表現出呼吸系統疾病癥狀，包括發燒、胸悶和咳嗽。聯合使用抗生素、抗病毒藥和糖皮質激素進行治療，但患者仍表現出呼吸衰竭，治療三天后病情并無改善。

　　該研究得到的序列可在NCBI的SRA數據庫中找到（BioProject登記號為PRJNA603194）。病毒完整基因組已存入GenBank，登記號為MN908947。

　　該文章經過Nicholas Loman等同行評審。Loman是英國伯明翰大學生物科學學院（School of Biosciences）教授，研究方向為微生物基因組和生物信息，目前H指數為45（2020年2月3日，Google Scholar）。

　　該文章曾于2020年1月25發表在預印版平臺bioRxiv上。

　　石正麗團隊分析了7例重癥肺炎患者的樣本，其中6人為武漢海鮮市場內的工人，該海鮮市場在2019年12月已首次發現病例。研究者發現在其中5名病人身上獲取的全長度基因組序列彼此之間幾乎完全一致（相似度超過99.9%），與SARS冠狀病毒有79.5%的序列一致。此外，研究人員發現該病毒序列與一種蝙蝠冠狀病毒在全基因組水平上相似度高達96%，表明蝙蝠可能是該冠狀病毒的來源。同時，研究人員發現七個被鑒定和測序出的非結構性蛋白也存在于SARS冠狀病毒中，表明該病毒是一種與SARS相關的冠狀病毒，將其命名為新型冠狀病毒2019（2019-nCoV），另外還確認了2019-nCoV進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣，即通過ACE2細胞受體（BioArt注：ACE2受體在2003年由李文輝博士等發現，見下圖。李文輝博士現為NIBS資深研究員，2012年還帶領團隊鑒定過乙肝受體NTCP。）。

　　支撐該研究發現的測序數據可在GISAID中找到，登記號為EPI_ISL_402124、EPI_ISL_402127-402130以及EPI_ISL_402131。

　　該文章曾于2020年1月23日發表在預印版平臺bioRxiv上（詳見BioArt報道：特別報道 | 相似度96%，石正麗團隊報道新型冠狀病毒或來源于蝙蝠）。

　　附張永振教授部分工作簡介

　　2016年11月3日，發表Nature文章Redefining the invertebrate RNA virosphere，從220個無脊椎動物中鑒定出了1445個RNA病毒。

　　2018年4月4日，發表Nature文章The evolutionary history of vertebrate RNA viruses，在多種脊椎動物中鑒定出了214個脊椎動物相關的病毒。

　　另外，除了Lancet開放冠狀病毒相關論文外，Nature和Cell出版社也加入了這一隊伍，開放了旗下所有雜志關于冠狀病毒的文章的閱讀權限。