處理腦疝在做出腦疝診斷的同時應按顱內壓增高的處理原則快速靜脈輸注高滲降顱內壓藥物，以緩解病情，爭取時間。當確診后，根據病情迅速完成開顱術前準備，盡快手術去除病因，如清除顱內血腫或切除腦腫瘤等。如難以確診或雖確診而病因無法去除時，可選用下列姑息性手術，以降低顱內高壓和搶救腦疝。
腦室外引流術
可在短期內有效地降低顱內壓，暫時緩解病情。對有腦積水的病例效果特別顯著。
減壓術
小腦幕切跡疝時可作顳肌下減壓術，枕骨大孔疝時可作枕下減壓術。這種減壓術常造成腦組織的大量膨出，對腦的功能損害較大，故非迫不得已不宜采用。
腦脊液分流術
適用于有腦積水的病例，根據具體情況及條件可選用：
①腦室腦池分流術；
②腦室腹腔分流術；
③腦室心房分流術等。
內減壓術
在開顱術中遇到腦組織大量膨出，無法關閉腦腔時，不得不作部分腦葉切除以達到減壓目的。但這只能作為一種最后的方法來考慮。