重樓屬植物主要生物活性物質為甾體皂苷,具有消炎、止血、抗腫瘤等功效,是云南白藥、宮血寧等86種著名中成藥的重要原料。重樓屬花葉組包括花葉重樓與祿勸花葉重樓兩種,與屬內其它植物相比,葉具斑塊,植株矮小,果實很小且產量低。花葉組重樓植物含有中國藥典規定的四種重樓皂苷。然而,花葉組重樓生長十分緩慢,對生長環境需求嚴格,野生品種采挖嚴重,人工種植難度高且規模小,花葉組重樓植物資源日漸枯竭,現已成為云南省級重點保護植物。目前,藥用植物因過度采掘瀕臨滅絕,藥用植物資源保護和可持續利用逐漸成為全球關注和亟待解決的問題。

葉綠體基因組蛋白質編碼基因的密碼子偏性分析
版納植物園生物信息組對重樓屬花葉組進行葉綠體基因組測序和分析。通過轉錄組比較,識別出包括串聯重復,散在重復等40個長片段重復,約130個簡單重復(SSRs)及一些變異熱區,并且對SSR采用香濃—維納指數(Shannon-Winener index),多肽信息含量指數(Polymorphic information content)計算以及系統發育樹構建等方式進行評估,獲得潛在的分子標記;發現幾乎所有蛋白質編碼基因偏好A/U結尾,突變和選擇壓力造成這種密碼子偏性;同時,預測大部分蛋白質編碼基因可能經歷了純化選擇,而光合作用有關基因經歷了相對較為不嚴格的純化選擇。以上研究結果將提高人們對花葉組重樓植物葉綠體基因組特征及其進化的認識,并為花葉組重樓后續種質資源研究奠定基礎。
該成果以Comparative chloroplast genomes of Paris Sect. Marmorata: insights into repeat regions and evolutionary implications為題發表于國際學術期刊BMC Genomics。此項研究得到了國家基金項目和重大研究計劃培育項目(31800273,31471220,91440113),云南省高端科技人才項目,中國科學院西雙版納植物園配套經費,中國科學院“西部之光”的聯合資助。
在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......
? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......
近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能基因組創新團隊發現煙草分枝發育“開關基因”,預示著未來作物株型調控有了新靶點。相關研究成果發表在《植物生物技術》(PlantBiotechnologyJourna......
薇甘菊作為全球十大最具危害的惡性入侵雜草之一,以其驚人的繁殖速度和強大的環境適應性,在亞洲、太平洋地區及中國華南地區造成嚴重生態破壞。然而,其基因組層面的適應性進化機制長期未被系統解析,制約了科學防控......