由遼寧省蠶業科學研究所牽頭,遼寧省農科院大連生物技術研究所、吉林省蠶業科學研究院、沈陽農業大學生物科學技術學院、河南省蠶業科學研究院、黑龍江省蠶業研究所組成的柞蠶基因組研究聯合攻關項目組(簡稱柞蠶項目組)與深圳華大基因科技服務有限公司(簡稱華大科技)攜手,經過兩年的不懈努力,日前完成了柞蠶全基因組重頭測序工作。這是我國蠶業科學家繼完成家蠶基因組框架圖及精細圖、桑樹基因組測序后,又一蠶業基因組突破性研究成果,將為改良柞蠶繭絲等性狀,創造實用新品種奠定分子生物學基礎,在世界野蠶研究領域具有里程碑式的意義。
我國是柞蠶發源地,蠶繭年產量8萬噸左右,占世界總產量90%以上,年產值25億元以上,蠶繭加工及綜合利用年產值約180億元。柞絲纖維具有突出的透氣、透水、柔韌、絕緣、耐酸堿等特點。較家蠶絲而言,柞蠶絲孔隙度大,更蓬松。
盡管柞蠶的人工馴化歷史已有2000多年,但其野生性仍較強。柞蠶項目組選取歷經近百代的自交提純與互交復壯的“膠蘭”作為試驗對象。“但這個物種雜合率仍超過千分之六,為降低物種復雜性帶來的組裝干擾,我們加深了大片段測序的深度,為后續的 scaffold構建提供了更多的數據支持,在高雜合、高重復的情況下,使得組裝指標達到精細圖標準N50 321.2Kb。”華大科技該項目負責人之一何榮軍介紹,“通過注釋發現,該物種的重復序列含量較高,尤其是TE中的LINE和DNA含量,遠高于一般動物,這可能是導致該物種基因組增大的原因。”
柞蠶項目組組長、遼寧省蠶業科學研究所姜德富研究員表示,啟動柞蠶基因組測序計劃,旨在獲得柞蠶基因結構組織的詳細信息,探討基因產物的功能,從分子水平上深入闡明柞蠶的生物學特性、泌絲機理以及與微生物的相互作用,為改良柞蠶繭絲等性狀、培育實用品種奠定基礎。
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