竹子是一種獨特的禾本科植物,它的莖稈生長迅速,如毛竹的幼嫩莖稈(筍)一天生長可達1米。這種特性使其能夠與其他樹木競爭,從而適應森林環境。以往對竹子木本莖快速生長特性的研究主要集中在形態學、解剖學和生理學方面。近期,我國科學家開展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其莖稈快速生長的遺傳機制,相關研究成果發表在《Molecular Biology and Evolution》期刊,標題為“New Genes Interacted with Recent Whole Genome Duplicates in the Fast Stem Growth of Bamboos”。
科研人員對毛竹基因組數據進行基因組系統發育地層學(phylostratigraphy)和演化轉錄組學分析,共鑒定出1622個近4600萬年前出現的竹子孤兒基因(特有新基因),其中19個是從頭起源(de novo)基因。在以往對其他植物的研究中,新基因主要在繁殖組織中高表達。這項研究發現,新基因在快速生長的竹筍中高度表達,并且表達量在快速生長的轉折點達到最高。研究還發現,全基因組加倍(whole-genome duplicates,WGD)基因也在竹筍中特異性地高表達,孤兒基因和WGD基因在莖稈快速生長的共表達模塊中富集,它們可能通過共同作用重塑了莖稈生長的表達網絡,從而驅動竹子快速生長這一特性的形成。
論文鏈接:https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab288/6377341