如果藥物治療經過一段時間無效或是乳房已增生多年而且成為患者感到極為煩惱的精神負擔時，或者較大的男性乳房發育或疑有癌變者則需通過外科手術切除增生肥大的乳房腺體組織。適應證包括：
①處于青春期末期或已過青春期仍有乳房發育的男性，乳腺直徑>4 cm，藥物治療無效；
②嚴重影響美觀者；
③疑有惡性變者。
Simon分類和Rohrich分類為GYN 手術方式的選擇提供了重要的臨床依據，外科醫師術前在選擇手術方式時，不僅要考慮到病人的發病原因、乳房的大小、肥大乳房的組織構成、有無多余皮膚等情況，而且還要考慮到病人對形體美觀的要求。第一個報道采用手術治療男子乳腺發育的外科醫生是Paulus Aegineta，1933年Menvill首次從整形外科原則考慮手術治療男子乳腺發育。現代的乳腺整形術大體可以分為3 種，即脂肪抽吸術、開放式切除術以及脂肪抽吸聯合開放式切除術。一般采用環暈入路切除乳暈下乳腺組織。近年腔鏡技術的應用提高了手術的安全性，國內范林軍等采用腔鏡技術對65 例男性乳房發育患者行皮下腺體切除術，認為全腔鏡乳房皮下腺體切除手術并發癥少、美容效果好，是大多數男性乳房發育的最佳手術方法。但一側乳房切除術后，另一側乳房也可以再出現發育，因此，要注意隨訪觀察，及時發現。如另一側乳房出現發育，藥物治療是有效的，不能消退時也可以再次手術切除。