近日，中國科學院成都生物研究所生物多樣性保護中心研究員徐波團隊圍繞新疆野生薔薇類群，開展了系統的野外調查與多維數據整合研究。團隊在新疆和四川地區收集并整理了252份材料，結合形態學、倍性分析與基因組證據，系統解析了新疆野生薔薇的多樣性格局、網狀演化歷史及潛在環境適應線索。相關成果于2月4日在線發表于《分子進化與系統發育》。
在形態學方面，研究團隊對多項定量性狀進行統計分析，并整合定性與定量特征構建綜合形態距離。結果顯示，基于定量性狀的PCA降維分析中，不同類群在形態空間重疊明顯，而整合定性與定量性狀的層次聚類可較好解析物種及譜系分組，且與核系統發育關系表現出較強一致性。進一步引入有監督機器學習篩選診斷性狀組合，可顯著提升類群判別能力（總體準確率達86.2%），為復雜類群的野外鑒定與標本復核提供了更可操作的性狀依據。
在基因組學方面，研究以二倍體材料為重點開展全基因組重測序，獲得過濾后約477萬個高質量SNP位點，用于系統發育、群體結構與基因流等分析。結果揭示新疆薔薇存在清晰的譜系結構，同時伴隨基因滲入與遺傳混合，表明其演化歷史具有顯著的網狀特征。
為進一步厘清不同基因組證據間的一致性與沖突來源，研究整合了葉綠體基因組與單拷貝核基因數據開展系統發育分析，發現核基因與葉綠體信號存在明顯不一致，并伴隨基因樹沖突，提示不完全譜系分選、雜交漸滲及葉綠體捕獲等過程，共同塑造了該類群的演化格局。
此外，研究通過性狀——環境關聯與選擇掃描等分析，識別到與脅迫響應相關的候選信號，并提出部分性狀（如花梗毛密度等）可能與熱——干旱環境梯度相關聯。相關適應機制仍需后續通過功能驗證或共同花園試驗等方式進行檢驗。
該研究通過形態、倍性以及基因組證據的多維整合，提升了新疆野生薔薇譜系界定與資源鑒定的可靠性，并為理解該類群在復雜地形與氣候梯度下的網狀演化與多倍化過程提供了新的證據。
相關論文信息：https://doi.org/10.1016/j.ympev.2026.108555