昆明動物所發表人類病毒組多樣性變化模型

　　病毒在人體內以病毒群落形式存在，這些病毒群落的集合即為人類病毒組（Human Virome）。與腸道菌群中的細菌相比，病毒數量是細菌數量的10倍以上。人類病毒群落包括內源性逆轉錄病毒、感染人類細胞的真核病毒、感染細菌的噬菌體和感染古菌的病毒。人體病毒群落與宿主間存在協同進化，因而存在著復雜的相互作用。現有研究發現，人體病毒組與許多疾病間存在緊密聯系，疾病可能影響病毒組的多樣性以及病毒組成，同時病毒組的改變也影響疾病的發病和進程。這些疾病不僅包括病毒源性的疾病，即由病毒感染直接引發的疾病，例如艾滋病、埃博拉出血熱和流行性感冒等，還包括非病毒源性疾病，例如囊性纖維化、牙周疾病、炎癥性腸病等。

　　近期，中國科學院昆明動物研究所計算生物與醫學生態學科組博士研究生肖琬蒙應用研究員馬占山先前提出的“多樣性-面積關系”（Diversity-Area Relationship, DAR系對經典 SAR(Species-area relationship)的擴展）分析方法，首次獲得了人類病毒群落多樣性在個體間的異質性、群體水平的潛在多樣性、以及“局部病毒群落”（例如單個人體病毒組）多樣性在“全球病毒宏群落”（例如一地區人群）中所占的比值（Ratio of local diversity to global diversity, LGD），并探究了疾病對這些參數的影響。研究發現，疾病對人類病毒群落在個體間多樣性、異質性的影響通常不顯著，而潛在病毒多樣性在健康對照與患者間可能存在顯著差異；人體病毒群落的LGD參數遠大于細菌群落。上述發現提示，盡管人體體內病毒個體數量是細菌數量10倍，但從群體角度看，個人對全球病毒多樣性貢獻比對細菌多樣性的貢獻高。

　　相關研究成果以Inter-Individual Diversity Scaling Analysis of the Human Virome with Classic Diversity-Area Relationship (DAR) Modeling為題，在線發表在Frontiers in Genetics上。肖琬蒙為論文第一作者，馬占山為論文通訊作者。研究工作得到國家自然科學基金、遺傳資源與進化國家重點實驗室以及中科院動物遺傳與進化交叉創新卓越中心的支持。