近日,美國PLoS ONE雜志發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所胡紅雨課題組的研究論文。該論文闡述了III型脊髓小腦共濟失調癥相關蛋白ataxin-3(AT3)中的串聯泛素結合模體(ubiquitin-interaction motif,UIM)的構象變化和UIM與泛素鏈結合的協同效應。
UIM是一類擁有泛素結合和促進泛素化功能的短肽序列。UIM存在于許多不同類型的蛋白質中,其氨基酸序列高度保守。除了與單泛素(mono-Ub)結合外,UIM還能夠與多泛素鏈(poly-Ub)結合。AT3是一種含有多聚谷氨酰胺(polyQ)的蛋白質,其polyQ附近有兩個相連的UIM序列(UIM12),對于結合泛素和促進底物泛素化有著十分重要的作用。
宋愛新博士等人利用核磁共振的方法,解析了UIM12在自由狀態和結合泛素狀態下的溶液結構,每一個UIM模體都由一個a-螺旋組成。當UIM12處于自由狀態時,這兩個螺旋之間沒有固定的取向,而當結合了泛素后,這兩個螺旋便形成了典型的螺旋-環-螺旋(helix-loop-helix)的折疊構象。核磁共振動態學數據也顯示,當UIM12結合了泛素后,兩個螺旋間的連接部分變得更為剛性。通過核磁共振化學位移干擾(CSP)和等溫滴定量熱(ITC)實驗,發現UIM12比單獨的UIM1、UIM2與泛素的結合力更強;而與結合單泛素相比,UIM12更傾向于結合通過K48或K63連接的二泛素鏈,并且兩個UIM之間的連接部分對于UIM12與二泛素鏈的結合起著重要作用。
這些證據表明,UIM12的連接區域通過構象和動態性質的變化,使兩個UIM模體以協同效應的方式與單泛素或二泛素鏈結合,這也許與蛋白質識別不同類型的多泛素鏈和泛素化底物有關。
該項研究與上海藥物所林東海課題組合作完成,工作得到了國家科技部、基金委、中國科學院的經費支持。
富含蛋白質的產品——從谷物、薯片到咖啡——擺滿超市貨架,但越來越多針對非人類動物的研究表明,限制蛋白質攝入或許能夠延緩衰老、延長壽命。那么,這是否意味著攝入過多蛋白質存在危害?美國威斯康星大學麥迪遜分......
荷蘭特文特大學科學家研發出一種光學方法,能夠實時追蹤單個蛋白質的形狀變化。它直接讀取蛋白質自身的分子振動,無需任何標記,即可揭示蛋白質對藥物、毒素及其他生物分子的響應。相關論文發表于新一期《美國化學學......
中國科學院上海藥物研究所(以下簡稱上海藥物所)研究員譚敏佳團隊,華東理工大學教授葉邦策團隊,上海藥物所研究員李靜雅團隊、徐駿宇團隊合作,首次發現并報道了一種由腸道菌群衍生代謝物苯乙酸(PAA)驅動的新......
項目概況華中師范大學薄層色譜質譜聯用儀、臺式核磁共振波譜儀等設備采購項目招標項目的潛在投標人應在武昌區中南路街民主路786號華銀大廈10層湖北世發招標有限公司或網絡(郵箱hbsfzb@sina.cn)......
近日,吉林大學發布了多個2026年5月-6月政府采購意向,計劃采購原子力顯微鏡、核磁共振波譜儀等,具體情況如下:序號采購單位采購項目名稱預算金額(萬元)預計采購日期1吉林大學正交相位干涉式原子力顯微鏡......
蛋白質形成復雜三維結構的速度甚至比DNA還要快。科學家首次直接測量出普通單個蛋白質折疊所需的時間,結果令人意外——蛋白質的氨基酸序列、分子大小與其折疊形成三維結構的耗時之間并無關聯。盡管蛋白質的組成成......
人工智能(AI)蛋白質結構預測工具“阿爾法折疊”迎來重要升級。17日最新發布的“阿爾法折疊”數據集首次大規模納入蛋白質復合物結構預測數據,數百萬個由AI預測的蛋白質復合物結構向全球科研人員開放。這一成......
記者1月7日從西湖大學獲悉,該校生命科學學院曹龍興實驗室和醫學院解明岐實驗室合作,從頭設計出一系列能夠控制蛋白質“組隊”的“遙控器”——可被小分子藥物精準調控的蛋白質多聚化系統。這意味著,科學家可以像......
美國艾倫研究所和霍華德·休斯醫學研究所科學家通過蛋白質工程技術,改造出一種特殊蛋白,名為iGluSnFR4,這是一種分子級“谷氨酸指示器”,可用于實時觀察大腦中神經元的交流過程。這一成果有助破譯大腦隱......
圖AI與化學生物學知識相融合設計超穩定性蛋白質模塊在國家自然科學基金項目(批準號:22222703、22477058)等資助下,南京大學鄭鵬團隊在蛋白質的可控設計及其穩定性研究方面取得進展,相關工作以......