最新測序的完整的人類基因組圖譜。
圖片來源:英國《新科學家》網站
20年前,科學家宣布讀取了一個人的全部脫氧核糖核酸(DNA),其實,他們漏掉了少許。現在,由于讀取DNA方法的改進,科學家終于可以從頭到尾讀取人類的全部基因組了!據生物預印本網站(biorxiv)近日報道,美國科學家對全部人類基因組30.55億個堿基對進行了測序,與此前結果相比,新結果增加了2億個堿基對以及2000多個基因。
人類擁有數萬個基因,它們儲存于DNA分子中,基因信息以4種堿基(C、G、T和A)的形式存在,兩個堿基相互配對形成堿基對。
科學家于1990年啟動了人類基因組測序項目,并于2001年公布了首個人類基因組草圖。但當時不得不將基因組分成小段讀取,然后重新組裝在一起,而這樣無法將一些高度重復的片段放回原位。隨后遺傳學家繼續改進,但重點還是放在提高現有序列的精確度,而非增加新序列,仍有約8%的序列缺失或錯誤。
新版本基因組由“端粒到端粒”(T2T)聯盟繪制。該聯盟由加州大學圣克魯斯分校的卡倫·米加和國家人類基因組研究所的亞當·菲利皮領導。
研究人員選擇從一個被稱為CHM13的細胞系中讀取DNA。該細胞系來自水泡狀胎塊——一種妊娠失敗情況,可以在實驗室中培養這種細胞。菲利皮說:“CHM13的獨特之處在于,它不是任何人的基因組。”
普通人類細胞的每段DNA都有兩個副本,往往存在重大差異,一個來自母親,另一個來自父親,這使得對DNA精確測序變得更加困難,因為要搞清楚什么是測序過程中的失誤、什么是真正的差異非常棘手。使用CHM13避免了這個問題,因為兩個副本幾乎完全相同。
為組裝基因組序列,研究團隊利用了兩種技術:一種是能讀取非常長(超過100萬個堿基對)片段的測序技術;另一種是精確度極高、能處理差別極小的片段(比如同一個基因的多個副本)的技術。
2020年7月,該團隊公布了完整的決定性別的人類X染色體。現在,他們公布了完整的人類基因組,新版本比上一個版本增加了近2億個堿基對以及2226個新基因,是自人類參考基因組首次發布以來進行的最大改進。
迄今規模最大的古代人類DNA研究表明,人類進化在過去1萬年里明顯加快。這項由美國哈佛醫學院的群體遺傳學家DavidReich聯合主導的研究,4月15日發表于《自然》。研究人員在涵蓋歐洲和中東地區的古代......
近日,湖北省農業科學院果樹茶葉研究所聯合華中農業大學園藝林學學院,在柑橘風味品質形成機制研究中取得新進展。研究團隊鑒定出一個可同時調控蔗糖積累與檸檬酸代謝的關鍵基因模塊,為柑橘風味品質定向改良提供了新......
近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心與中國科學院天津工業生物技術研究所合作,研究開發了一種集成的、高靈敏度且高通量的錯誤校正平臺eMBS。能夠通過理性設計工程化MutS蛋白并結合磁珠分離......
據報道,上個月法國發生的一起案件,在一把槍上發現了同卵雙胞胎兄弟的DNA,但他們擁有相同的DNA,所以傳統的DNA檢測方法,無法確定DNA屬于哪位兄弟。在法國一起刑事審判中,傳統的DNA檢測未能區分出......
近日,中國農業科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種創新團隊利用多基因激活系統,在茶樹根系中實現了茶氨酸生物合成的2個關鍵基因同步激活,顯著提高了茶氨酸含量。相關結果發表在《園藝研究》(Horticulture......
27日的《科學》雜志發表了一項研究,揭示了人類基因組中一類可“跳躍”的DNA片段——被稱為遺傳“寄生蟲”的LINE-1(L1)元件,如何成為破壞癌癥基因組穩定性的主要力量。基因組的不穩定正是癌癥演化的......
一艘沉沒于150年前的船經歷了怎樣的航程?科研人員從出水瓷瓶內的沉積物中,“打撈”出了它的生命史。通過對長江口二號沉船出水青花雙耳瓶中的土壤沉積物進行環境因子與沉積物古DNA分析,來自復旦大學、華東師......
在近日一項發表于《自然》的研究中,科學家繪制出迄今最詳盡的人類活細胞內DNA折疊、環狀纏繞和移動的圖譜,展示了基因組結構隨時間推移的變化情況,揭示了隱藏的基因調控機制,是了解DNA結構如何塑造人類生物......
圖基于卷對卷流體的新一代快速低成本基因測序技術在國家自然科學基金項目(批準號:22027805、22334004、22421002)等資助下,福州大學楊黃浩、陳秋水團隊與華大生命科學研究院秦彥哲、章文......
圖基于卷對卷流體的新一代快速低成本基因測序技術在國家自然科學基金項目(批準號:22027805、22334004、22421002)等資助下,福州大學楊黃浩、陳秋水團隊與華大生命科學研究院秦彥哲、章文......