從美國約翰·霍普金斯大學醫學院回國，李勇杰教授進入首都醫科大學宣武醫院功能神經外科是1998年。這一年，李勇杰創辦了中國第一家功能神經外科領域的臨床治療和科研機構；他帶回的“細胞刀”技術開始在中國生根發芽，真正造福于國內超過200萬的帕金森病患者。
十幾年來，李勇杰帶領他的團隊診治十余萬患者，足跡遍及全國30個省、市、自治區和港澳臺，甚至還有來自美國、日本的遠道求醫者。數千例帕金森病患者在神奇的“細胞刀”治療后，肌肉不再震顫僵直，失去的生活工作能力得以恢復。
李勇杰說，他希望自己能成為一名科學家型的醫生，不是簡單地當醫生，而是要做研究、搞創新。“其實‘細胞刀’是十幾年前的事了，我們早已開始運用更前沿的技術手段來治療更多疾病，將治療范圍拓展到了癲癇、疼痛以及腦癱等多領域。”
“要病人放心地把腦袋交給我們，讓我們在里面動刀子，必須依靠極大的信任。”李勇杰認為，這需要醫生首先胸懷仁愛之心。他常常告誡自己，面對手術刀下經過數百萬年進化的腦組織要深懷敬畏之心；他也常常叮囑年輕大夫們，要珍惜醫院給予的平臺和患者給予的信任，認真謹慎地對待每一位患者。
現在最讓李勇杰自豪和驕傲的，莫過于業已成型的團隊。他很欣慰地說：“帶領這樣一個團隊，經常讓我有如沐春風的感覺。我對未來信心百倍，憧憬多多。”