填充柱的制備包括固定液、載體和溶劑的選擇及載體的涂漬、柱的填充、柱的老化等程序。
一、根據樣品選擇固定液和載體。
二、根據固定液選擇溶劑。
三、根據配比和所需固定相的量，計算所需固定液的量和載體的量。
四、載體的涂漬：
將稱好的固定液放在一個燒杯中，加入適量的溶劑溶解。將稱好的載體倒入溶解好固定液的燒杯中，在適當的溫度下，輕輕搖動燒杯，讓溶劑均勻揮發。如果溶劑沸點高，可在紅外燈泡下烘干，直至載體呈顆粒狀，沒有溶劑氣味為止。
五、柱的填充：
1、柱的清洗：
用水和有機溶劑清洗干凈，并烘干。
2、柱的填充：
用玻璃棉將柱的一端（接檢測器的一端）塞牢，經緩沖瓶與真空抽氣機連接，柱的另一端接一漏斗，徐徐倒入涂有固定液的載體，邊抽真空邊輕敲柱管，直至裝滿為止。用玻璃棉塞緊倒入載體的柱的端口。
六、柱的老化：
1、目的：
徹底除去填充物中的殘留溶劑和某些揮發性的物質，促使固定液均勻牢固地分布在載體的表面。
2、方法：
在常溫下使用的填充柱，可直接裝在氣液色譜儀上，接通載氣，沖至基線平穩即可使用。
如果新裝填好的填充柱要在高溫操作條件下使用，要將裝填好的填充柱接在氣液色譜儀上，但柱出口不要與檢測器相連，以防止加熱時從柱內揮發出的雜質污染檢測器。在操作溫度低于最高使用溫度下，通入載氣，將柱加熱幾小時至幾十小時，這一過程稱為老化。老化時，升溫要緩慢。老化后，將填充柱與檢測器連接上，待基線平穩后即可進樣分析。