淋巴細胞性脈絡叢腦膜炎的尸檢結果是：在大腦皮質普爾基涅氏細胞層有廣泛的血管周圍單核細胞浸潤。用免疫熒光法在腦膜和腦皮質的神經細胞中檢出病毒抗原，這表明病毒直接侵犯神經細胞。南美的出血熱和拉撒熱的發病機理還不十分清楚。病毒侵入后，在淋巴樣組織增殖，產生病毒血癥，然后引起出血和血管通透性增加。
出血可能是血小板減少和凝血障礙所致。另外，受病毒直接侵犯的細胞釋放出一些介質，造成血管通透性增加，導致血漿蛋白、水和電解質外滲，引起血溶量降低，甚至休克。受損害的器官有肝、腎、心、肺、皮膚、腦和單核吞噬細胞系統。不同的疾病受損害的程度各異。脾、淋巴結和骨髓內有大量病毒。拉撒熱的病理損害波及多種組織。