焦磷酸測序(Pyrosequencing)技術是新一代DNA序列分析技術,該技術無須進行電泳,DNA片段也無須熒光標記,操作極為簡便。
Pyrosequencing技術是由4種酶催化的同一反應體系中的酶級聯化學發光反應(參見Pyrosequecing的原理),在每一輪測序反應中,只加入一種dNTP,若該dNTP與模板配對,聚合酶就可以將其摻入到引物鏈中并釋放出等摩爾數的焦磷酸基團(PPi)。
PPi可最終轉化為可見光信號,并由PyrogramTM轉化為一個峰值。每個峰值的高度與反應中摻入的核苷酸數目成正比。然后加入下一種 dNTP,繼續DNA鏈的合成。
瑞典 Pyrosequencing AB公司基于Pyrosequencing技術而研究開發的PSQ
96系統是一個理想的遺傳分析技術平臺,它既可進行DNA序列分析,又可進行基于序列分析的SNP檢測及等位基因頻率測定。我公司是國內最早引進PSQ
96 MA 技術平臺的公司之一,它具有以下優點:
不需要制膠,不需要毛細管,也不需要熒光染料和同位素。
10分鐘內可分析96個樣品的SNP,可滿足高通量分析的要求。
每個樣品孔都可進行獨立的測序或SNP分析,實驗設計靈活。
序列分析簡單,結果準確可靠。
Pyrosequencing技術的原理
Pyrosequencing是一項全新的DNA測序技術,可以快速、準確地測定一段較短的目標片段。其基本原理如下:
第1步:1個特異性的測序引物和單鏈DNA模板結合,然后加入酶混合物(包括DNA Polymerase、ATP Sulfurylase、Luciferase和Apyrase)和底物混合物(包括APS和Luciferin)。
第2步:向反應體系中加入1種dNTP,如果它剛好能和DNA模板的下一個堿基配對,則會在DNA 聚合酶的作用下,添加到測序引物的3’末端,同時釋放出一個分子的焦磷酸(PPi)。
第3步:在ATP硫酸化酶的作用下,生成的PPi可以和APS結合形成ATP;在熒光素酶的催化下,生成的ATP又可以和熒光素結合形成氧化熒光素,同時產生可見光。通過CCD光學系統即可獲得一個特異的檢測峰,峰值的高低則和相匹配的堿基數成正比。
第4步:反應體系中剩余的dNTP和殘留的少量ATP在Apyrase的作用下發生降解。
第5步:加入另一種dNTP,使第2-4步反應重復進行,根據獲得的峰值圖即可讀取準確的DNA序列信息。
Pyrosequecing技術操作簡單,結果準確可靠,可應用于SNP位點檢測、等位基因頻率測定、細菌和病毒分型等領域。
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